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启动作业 功能描述 通过引用本地参数文件,启动nextflow作业。 命令结构 health nextflow create job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --workflow-id -w 是 nextflow作业ID。 --name -n 是
API(盘古辅助制药平台) CSS集群管理 药物通用接口 药物数据库管理 药物作业管理 自由能微扰作业管理 分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI作业管理
CSS集群管理 绑定CSS集群 获取CSS集群列表 获取最终租户CSS集群列表 测试CSS集群连接 CSS集群解绑 父主题: API(盘古辅助制药平台)
# 子任务的参数数值,根据参数类型进行合法性校验 - 'gwj-test-01:/test' - task_name: app1-2 app_id: 'demo-app::1.0.0' display_name:
创建流程 功能介绍 创建流程 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/workflows 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String
更新流程 功能介绍 更新流程 URI PUT /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/workflows/{workflow_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选支持使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。该流程可以实现以下功能。 整合分子对接结果,生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象,用于可视化展示。 对配体分子进行注释,包括DrugBank编号、
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题: 系统管理
(DILI),药物肝损伤。0为DILI阴性,1为DILI阳性,数值范围在0~1之间。 结果解释:预测值的范围在0~1之间。 AMES Toxicity: The Ames test for mutagenicity,致突变试验。0为AMES阴性,1为AMES阳性,数值范围在0~1之间。 结果解释:预测值的范围在0~1之间。
# 子任务的参数数值,根据参数类型进行合法性校验 - 'gwj-test-01:/test' resources: # 子任务的资源配额
Notebook安装Conda指导 打开Notebook,在“File”页签下选择“Terminal”。 图1 选择Terminal 下载和安装Anaconda。 获取Repository和Anaconda安装包。 Repository: https://repo.anaconda
种分析流程,帮助您快速完成分析任务。 Notebook Notebook是一个交互式应用程序,提供开发调试、代码运行、文档编写和结果展示等功能。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 镜像 Docker镜像是一个模板
# 子任务的参数数值,根据参数类型进行合法性校验 - 'gwj-test-01:/test' - task_name: app1-2 app_id: 'demo-app::1.0.0' display_name:
更新自动作业模板 功能介绍 更新自动作业模板 URI PUT /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs/{auto_job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
确保团队高效协作。 医疗智能体面向的用户 从行业方向上,医疗智能体主要面对以下行业的从业者: 药物研发公司 平台以AI技术为核心的药物研发功能,通过内置的AI模型,加速药物研发过程。 科研单位 平台以流程管理及Notebook为核心,内置了常见的基因组数据分析流程,科研工作者可以
务。 图2 查看导入用户 医疗平台用户会在IAM中赋予以下细粒度权限,若该用户加入的其他IAM用户组有对应的deny权限,则会影响平台部分功能使用。 { "Version": "1.1", "Statement": [ { "Effect":
启动作业 功能介绍 启动作业 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平
查询分子搜索任务 功能介绍 通过分子搜索任务ID查询分子搜索任务状态及结果。 URI GET /v1/{project_id}/task/search/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id task_id
恢复:删除的项目在删除后6天内都可以恢复成“可用”或者“冻结”状态。 图1 项目管理 分享项目 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户,才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 已创建一个项目。 操作步骤 单击“操作”列“分享”。 图2
、SD SDF、PDBQT格式。 受体蛋白:受体蛋白文件,支持PDB、PDBQT格式。 图3 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库模板:使用资产市场订阅的流程时,模板已预置,无需选择数据库模板。 数据库名称:数据库的名称。