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LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 获取软件包。 获取IBM Spectrum MPI软件包。 下载地址:https://www-01.ibm.com/marketing/iwm/iwm/web/preLogin.do?source=swerpsysz-lsf-3 获取的软件包一般
已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Spectrum MPI。 获取IBM Spectrum MPI软件包,需要进行注册。 获取的IBM Spectrum MPI软件包有两个,包括license和软件两部分: ibm_smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Aug11.x86_64
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
依次登录集群中其他BMS,重复执行步骤1~5。 执行以下命令,验证参加测试的BMS之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
STAR-CCM+15.02.009_01_linux-x86_64-2.12_gnu7.1-r8.sh # 从STAR-CCM+官网买的正版软件中获取license,将license.dat文件放到/opt/Siemens 中 echo “export CDLMD_LICENSE_
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象: dtest/rping打流测试网络双向不通问题:A机器作为Server端,B机器作为Client端,dtest/rping测试RoCE网络异常;调换A、B机器角色,B机器作为Server端,A机器作为C
创建裸金属服务器集群 操作场景 若您需要将您的服务部署在裸金属服务器上,首先需要购买裸金属服务器。 购买须知 专属物理资源 如果您希望裸金属服务器运行在隔离的专属区域,请您先申请专属云,再创建裸金属服务器。 了解和申请专属云,请参见《专属云用户指南》。 如果您希望裸金属服务器拥有独
3-x86_64.tbz”。 下载地址:https://developer.nvidia.com/networking/hpc-x 将下载的软件包拷贝到BMS内(建议在“/home/rhel”目录下)。 执行以下命令,解压HPC-X工具套件,并修改HPC-X工具套件目录。 # tar
com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/ 图2 IB驱动的下载页面 执行以下命令,安装软件包。 # yum install tk tcl # tar -xvf MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-rhel7.3-x86_64
0/openmpi-4.0.2.tar.bz2 将下载的OpenMPI压缩包拷贝至BMS内(建议在“/home/rhel”目录下)。 执行以下命令,解压软件包。 # tar -xzvf openmpi-4.0.2.tar.bz2 # cd openmpi-4.0.2 执行以下命令,安装所需要的
可选配置,主要用于创建弹性云服务器时向弹性云服务器注入脚本文件或其他文件。配置文件注入后,系统在创建弹性云服务器时自动将文件注入到指定目录下。 用户数据注入 可选配置,主要用于创建弹性云服务器时向弹性云服务器注入用户数据。配置用户数据注入后,弹性云服务器首次启动时会自行注入数据信息。 云服务器组 可
6 虚拟私有云(VPC) 为云服务器等云上资源构建隔离、私密的虚拟网络环境。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘(EVS) 为ECS、BMS等计算服务提供持久性块存储的服务。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 8 对象存储服务(OBS) 提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。
com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/ 图2 IB驱动的下载页面 执行以下命令,安装软件包。 # yum install tk tcl -y # tar -xvf MLNX_OFED_LINUX-4.6-1.0.1.1-rhel7
础设施之上推出了HPC解决方案服务(HPC Solution Service,简称HPC-S²),主要面向对大规模计算有需求的企事业单位,为用户提供一站式可扩展的高性能计算,同时集成基础服务、业务软件等,实现一键式开通部署等功能,支持常用作业调度软件,例如slurm、sge及华为多瑙(Huawei
Turbo存放算例文件。 HPC仿真软件STAR-CCM+需要每个节点都安装,比较麻烦,可以将STAR-CCM+直接安装在NAS存储中,每个节点直接将NAS挂载到本地盘中,简化安装,使用更加方便。 购买SFS Turbo 1.在华为云控制台搜索“弹性文件服务 SFS”,并在弹性文件服务页面右上角选择“创建文件系统”。
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens
器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。 基于消息的事务:数据被作为离散消息处理,而不是作为流,这消除了应用将流分成不同消息/事务的需要。 分散/收集条目支持: RDMA支持本地处理多个分散/收集条目,即读取多个内存缓冲区并将
择。 私有镜像 用户基于弹性云服务器创建的个人镜像,仅用户自己可见。包含操作系统、预装的公共应用以及用户的私有应用。选择私有镜像创建弹性云服务器,可以节省您重复配置弹性云服务器的时间。 您可以选择使用加密镜像,更多关于加密镜像的信息,请参见《镜像服务用户指南》。 共享镜像 您将接