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资产管理 获取资产列表 获取属性值列表 查询资产详情 查询资产版本详情 更新资产指定版本的信息 删除资产指定版本 操作资产发布状态 父主题: 资产市场
设置作业名称 作业设置完成后,会显示流程中的各个应用信息,再此可以指定实际的运行参数。 图7 NGS流程 单击图标,可设置数据来源,可以指定File或者Directory类型参数。这里我们将NA12878目录下的两个fastq文件分别指定成fastp-file1和fastp-file2。 图8
镜像管理 发布镜像 导入镜像 订阅镜像 更新镜像描述信息或者类型 删除镜像仓库 批量删除镜像tag 删除指定镜像tag 获取镜像列表 创建镜像 获取docker login指令 获取指定镜像的tag列表 父主题: 项目管理
命令中的archive可替换为backup 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 archive-id 无 否 归档id,不指定id表示获取归档列表,指定id表示获取归档详情。 --limit -l 否 限制量,单次查询总量,必须由数字组成,默认为10,取值范围[0,1000],获取归档列表时生效。
如果源文件是主机上的zip或者tar形式的压缩文件,Docker会先解压缩,然后将文件添加到镜像的指定位置。 如果源文件是一个通过URL指定的网络压缩文件,则不会解压。 VOLUME 在镜像里创建一个指定路径(文件或文件夹)的挂载点,这个容器可以来自主机或者其它容器。多个容器可以通过同一个挂
同,可参考。 通过指定“app-id”修改应用。 health edit app 550e8400-e29b-41d4-a716-446655440000 -y D:\template.yaml # 返回结果如下 edit app succeed! 通过指定“app-name:
--help查询支持的操作命令。Linux系统下,需添加./指定当前路径。 执行操作命令,获取项目信息。 执行health get project命令查询当前账号下所拥有的项目和项目信息。Linux系统下,需添加./指定当前路径。 使用数据、应用、流程、作业命令时,需先使用swi
eport_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 命令示例 本节以Windows为例介绍eiheal
ID 无 否 不选此参数时,列出当前所在项目的所有流程信息。 指定workflow-id或workflow-name:version:srcproject,列出具体应用的信息,srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --sample -s
eport_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 --recover -z 否 待恢复上传任务结果清单文件的任务号。
Nextflow作业管理命令 启动作业 查询作业 删除指定作业 重试作业 停止作业 获取任务信息
跳过的header行数。不指定参数值时默认为0。 --delimiter -e 否 常用的三种分隔符为(;,\t),也可以根据导入数据的文件格式设定其他分隔符。 --files -f 否 生成实例数据的文件列表,多个文件用分号(;)分隔。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 查询指定镜像名下的所有tag信息,支持模糊查找。 --type -t 否 查询某个类型的镜像,可选APP、NOTEBOOK、OTHER。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 查询当
EIHealth作业管理命令 作业配置文件说明 启动作业 查询作业详情 删除指定作业 重试作业 取消作业 导出作业 获取任务实例
数据归档 删除归档 获取指定归档的全数据清单 恢复归档 查询归档列表 归档数据 父主题: 数据管理
ile、threads,输出参数为output-dir,则镜像启动命令如下所示。 使用-t命令,指定运行所需的线程数量。-o命令,指定存放输出结果的文件夹。输入文件夹已在填写参数时指定。 fastqc -t ${threads} -o ${output-dir} ${input-file}
执行队列,使用','分隔多个值 cpus Integer 指定task执行需要的cpu数量 memory String 指定task执行需要的内存大小 disk String 指定task执行需要的磁盘大小 time String 指定task执行需要的时间 表6 NextflowTaskResourceUsage
eport_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 --recover -z 否 待恢复下载任务结果清单文件的任务号。
购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果支付时间晚于指定生效时间,资源包将在支付后立即生效。 图2 购买套餐包 设置完成后,单击“立即购买”,然后单击“确认”。 在云服务订单页面,单击“确认付款”。
数据库管理命令 创建数据库模板 获取数据库模板 删除数据库模板 导入数据库模板 创建数据库实例 获取数据库实例 删除数据库实例 引用数据库或者导入数据到指定数据库 修改数据库实例