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详细项目成员角色和权限介绍请参见成员角色和权限。 图7 移除、修改项目成员 选中成员,单击“移除”,将成员从项目中移除。选中多个成员,可进行批量移除,一次最多选中五个成员。 成员角色和权限 在项目中,成员可以划分为5种不同的角色。详细角色介绍请参考表 项目成员角色,详细角色权限请参考表
MOL Editor Mol Editor工具可以查看小分子的2D结构,以及编辑分子结构。 单击“功能模块 > 通用工具 > MOL Editor”,进入Mol Editor页面即可操作。可以通过单击右上角的“保存”,将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题:
--parallel -p 否 上传文件时,每个分段上传任务数的最大并发数,默认为5。取值范围[1,10]。 --jobs -j 否 上传文件夹时,批量任务的最大并发数,默认为5。取值范围[1,10]。 --fr -R 否 上传对象时生成结果清单文件。 --arcDir -g 否 上传文件
自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 同步上传文件夹时批量任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。 同步文件夹时该参数可选。 --exclude
步骤4:查看与执行操作命令 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。配置信息导入后,即可查询命令行工具支持的操作,并执行相关命令,使用EIHealth平台。 详细的操作命令请参见其他章节。 查询操作命令列表。
MOL 3D Viewer Mol 3D Viewer工具支持查看蛋白质和小分子的3D结构。单击“功能模块 > 通用工具 > MOL 3D Viewer”,进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括: 本地分子结构的3D可视化,支持多种显示样式,支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。
去金属离子:去掉受体蛋白里面的金属离子。 去水、去金属离子参数默认是勾选状态,若上传的受体中包含配体,提交任务时系统会自动删除配体。 单击“应用全局",可以对受体进行批量处理。 单击“下一步”,进入配体预处理页面。 单击“上传配体”后的,选择配体文件。 配体文件仅支持输入1个文件。 配体支持SDF、MOL2、PDB、
将其他项目或本项目的数据,复制到本项目中,并可在本项目中操作该数据。 单击数据中心右上角“复制”。 选择需要复制的项目数据,选择导入数据的路径。 您可以选中多个文件夹进行批量复制。 复制数据时可单击图标创建文件夹。 图2 复制数据 单击“确认”,复制其他项目中的数据至本项目。 引用数据 将其他项目或OBS桶中的
将其他项目的数据,复制到本项目中,并可在本项目中操作该数据。 单击“添加数据”,类型选择“复制”。 选择需要复制的项目数据,选择导入数据的路径。 您可以选中多个文件夹进行批量复制。 复制数据时可单击图标创建文件夹。 图2 复制数据 单击“确认”,复制其他项目中的数据至本项目。 引用数据 将其他项目或OBS桶中的
方式1:使用预置的NGS流程 使用EIHealth平台预置的流程进行运行作业。 步骤1:订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程,以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2:订阅数据 若您
QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。 聚类分析 目前分子属性预测返回的结果小分子数较多,无法进行批量分析,通过一些聚类的辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证,提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一
请求URI 参数 说明 URI-scheme 传输请求的协议,当前所有API均采用HTTPS协议。 Endpoint 承载REST服务端点的服务器域名或IP,不同服务在不同区域时,对应Endpoint不同,可以从终端节点中获取。 例如EIHealth服务在“华北-北京四”区域的Endpoint为“eihealth
Content 重置内容,服务器处理成功。 206 Partial Content 服务器成功处理了部分GET请求。 207 Multi status 批量操作部分成功部分失败 300 Multiple Choices 多种选择。请求的资源可包括多个位置,可返回一个资源特征与地址的列表用于用户终端(例如:浏览器)选择。
什么是医疗智能体eihealth-toolkit 医疗智能体命令行工具(eihealth-toolkit)是配套EIHealth平台,为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具,可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。
删除notebook 使用delete命令删除notebook。 命令结构 health delete notebook <notebook-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-id 无 是 notebook id。 --project
编辑notebook 使用update或edit命令更新notebook描述信息。 命令结构 health update notebook <notebook-id> [flags] 或者 health edit notebook <notebook-id> [flags] 表1
创建notebook 使用create命令创建notebook。 命令结构 health create notebook <notebook-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-name 无 是 notebook名称。 取值范围[1
启动notebook 使用start命令启动notebook。 命令结构 health start notebook <notebook-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-id 无 是 notebook id。 --project
停止notebook 使用stop命令停止notebook。 命令结构 health stop notebook <notebook-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-id 无 是 notebook id。 命令示例 本节以Wi
上传大于1GB数据 当数据过大,或者数据处于服务器上时,页面传输并不是很方便,所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令,将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。