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务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为,进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上,通过基本原理,构筑起一套模型和算法,从而计算出合理的分子结构与分子行为。SPONGE(Simulation Package
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n。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 method 是 String 差异计算方法:RMSD、EMD。 枚举值: RMSD EMD file 是 DrugFile object 配体文件。 ref_file 是 DrugFile
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将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 bwa-mem:0.7.17 该镜像由bwa和samtool合并而成,镜像制作方法请参见制作bwa-mem镜像。 Insert Size Estimation 针对构建Index后的bam文件,统计测序数据的Insert
ken。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 method 是 String 聚类方法,当前仅支持hiq_mc。 最小长度:1 最大长度:20 file 是 String 分子聚类源数据。 最小长度:1 最大长度:2000 output_dir
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钟粒度)、one_hour(1小时粒度),不填时默认为real_time 缺省值:real_time method 否 String 统计方法。枚举值,取值范围:max(最大值)、min(最小值)、average(平均值),不填时默认为max 缺省值:max metric_name
ProbeDrugFile object 探针文件。 params PocketDetectionParamDto object 靶点口袋发现设置参数。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称,取值范围:[1
concurrent: vars_iter # 是否并发,取值 vars_iter 时为开启并发状态,不设置则不开启 description: '' # 参数描述。取值范围:[0-255]