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String 内存物理规格描述信息 netcard_detail String 网卡物理规格描述信息 cpu_arch String 裸金属服务器的CPU架构类型 gpu_info String GPU信息 请求示例 查询计算资源规格 /v1/{project_id}/system/
点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无
空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 响应参数 无 请求示例 更新药物作业,设置标签为label_A和lable_B。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-proje
监控指标名称 resource_id String 监控资源id device_id String 显卡id 请求示例 批量下载监控数据,设置起止时间,实时数据,统计方式为max, 指定资源id列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
最大值:500 数组长度:3 - 3 padding 是 Float 口袋的padding值。 最小值:0 最大值:20 响应参数 无 请求示例 设置口袋中心位置、大小和padding的值生成可渲染的口袋文件内容。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/d
Array of floats z坐标集。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:1 - 500 响应参数 无 请求示例 设置离散点坐标集为x_coord_list[0.1, 0.2, 0.3]、y_coord_list[0.1, 0.2, 0.3、z_coord_list[0
xxx,则可以确认为作业超时失败。 解决方法 根据实际业务需要,在“创建作业”阶段,设置合适的超时时间,默认设置的超时时间为24小时(1440分钟),最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 图1 作业设置 场景2 作业投递后处于运行中,但是无日志打印,也没有任何符合预期的输出文件生成。
数据库id。 请求示例 创建数据库,数据库名称为database_name,选择css集群,上传项目桶中file/test.csv的数据库数据,设置列名为SMILES和NAME,打开共享开关。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/drug-database
分子SMILES表达式为string,靶点设置的受体文件为project:/test.pdb,口袋中心位置为[0,0,0],口袋尺寸大小为[500,500,500],设置弱约束为eye_corrosion,类型为布尔值,值为true,设置强约束为sascore,类型为range,值为[0
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为project:/dir/file,靶点设置的受体文件为project:/test.pdb,口袋中心位置为[0,0,0],口袋尺寸大小为[500,500,500],设置弱约束为eye_corrosion,类型为布尔值,值为true,设置强约束为sascore,类型为range,值为[0
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
进入流程设计器页面。单击输入参数图标,设置输入数据。 图6 流程设计器 单击应用图标,弹出编辑图标,单击按钮,设置应用参数。 在“高级参数”下面可以设置加速类型。如果作业加速类型选择“无”,task加速类型可以任意选择。如果作业加速类型选择IO加速或者本地盘加速,则此处task加速类型无法设置。 参数确认
对于pod配置,暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Process执行失败。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/process.html#pod 对于publishDir配置,用户侧设置时需要使用一定的技巧。目前测试结果表明下面两种写法是可行的,
最大长度:63 响应参数 状态码: 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 项目id 请求示例 创建项目,设置描述、名称、标签 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-projects
最小长度:0 最大长度:10000000 add_hydrogen 否 Boolean 增加氢原子。 缺省值:true 响应参数 无 请求示例 设置受体蛋白文件为1TQN.pdb,配体小分子为1TQN.pdb,拼接成复合物结构。 https://{endpoint}/v1/{proje
安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装,安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块,单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
--commands -c 否 镜像启动命令。设置方法请参见创建FastQC应用样例。 --image -i 否 镜像地址。获取方法请参见获取镜像地址。 --labels -l 否 标签,多个标签使用;符号分隔开。 --nodeLabels -n 否 用于让应用调度到设置了该标签的节点上。 标签数量取值范围[0
免误删造成损失。 在“数据”页面单击“归档”,进入归档数据页面。 图1 选择归档 填写归档的参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型 选择归档数据存储类型。默认为标准存储。 标准存储:适合高性能,高可靠,高可用,频繁访问场景。
项目简介 项目是EIHealth平台的一个工作空间,可以在项目中存储数据,上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中,并通过设置成员角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。您可