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在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在集群上运行MPI应用。 IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤1.1~步骤1.3,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看ECS的主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤2.1~步骤2.2,获取所有ECS的主机名。
执行mount -a 备注: 192.168.0.15:/ 是从sfs turbo console中获取到的挂载的路径。 第1个1表示备份文件系统,第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测,0表示不检测,_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过,避免无法挂载主机无法启动。 设置服务开机自启动
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
若以上方法无法解决,请联系技术支持进行处理。 STAR-CCM+启动时,报错“Address is not valid” 问题现象: STAR-CCM+使用启动时报错地址不合法,出现提示"Address is not valid"。 解决方案: 1.请参照STAR-CCM+安装与运行中“运行OpenMPI下
3的HPC-X版本是“hpcx-v2.2.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-redhat7.3-x86_64.tbz”。 下载地址:https://developer.nvidia.com/networking/hpc-x 将下载的软件包拷贝到BMS内(建议在“/home/rhel”目录下)。
RDMA RDMA概念 远程直接内存访问(即Remote Direct Memory Access)是一种直接内存访问技术,它将数据直接从一台计算机的内存传输到另一台计算机,无需尤其是面对高性能计算HPC、大数据分析和浪涌型IO高并发、低时延应用,现有TCP/IP软硬件架构和应用
命令查看 关闭超线程 系统默认关闭,如果是打开的,需要进行关闭。 判断系统是否开启超线程。 通过查询系统的物理核数和逻辑核数的关系可以判断是否开启多线程,如果:逻辑核数 = 物理核数,说明没有开超线程;逻辑核数 = 2*物理核数,说明系统开启了多线程。 Linux系统可以通过查询/pr
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
RoCE RoCE概念 RDMA over Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议,允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本,v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v
04.03r-ce.bin 安装Platform MPI。 # ./platform_mpi-09.01.04.03r-ce.bin 根据系统提示安装Platform MPI,默认安装到“/opt/ibm/platform_mpi”文件夹下。 图1 Platform MPI成功安装
安装IB驱动。 下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.6-1.0.1.1-rhel7.6alternate-aarch64.tgz”。 下载地址:https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/
如果未安装IB驱动,执行2。 安装IB驱动。 下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-rhel7.3-x86_64.tgz”。 下载地址:https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象: dtest/rping打流测试网络双向不通问题:A机器作为Server端,B机器作为Client端,dtest/rping测试RoCE网络异常;调换A、B机器角色,B机器作为Server端,A机器作为C
安装和使用MPICH 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行MPICH应用(mpich-3.3.2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装MPICH。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
Platform MPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Platform MPI应用(platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Platform MPI。 操作步骤
/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/tests/imb/IMB-MPI1 PingPong 图4 集群运行IB驱动自带OpenMPI 系统回显如图4所示,表示集群上运行IB驱动自带的OpenMPI成功。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)