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host-192-168-0-75 /root/spe_hello 图1 在集群上通过Spectrum MPI运行可执行文件 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用
依次登录集群中所有BMS,重复执行2.e~2.f。 执行以下命令,在BMS集群上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 12 -machinefile hostfile /home/rhel/hello 图3 BMS集群上Platform MPI运行成功 hostfile文件在
依次登录集群中所有BMS,重复执行2.e~2.f。 执行以下命令,在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 $ mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行Spetrum MPI成功 hostfi
在HPC集群上运行Intel MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群(以CentOS7.3为例)上运行Intel MPI应用(l_mpi_2018.0.128版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
在HPC集群上运行Platform MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群(以CentOS7.3为例)上运行Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。
hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
hostfile /home/rhel/hello 图2 集群上运行社区OpenMPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行社区OpenMPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 检查环境变量 在单个BMS上运行Platform MPI。 执行以下命令,重新编译hello.c文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Platform MPI。 $ mpirun -np
2a1/tests/imb/IMB-MPI1 PingPong 图3 集群运行IB驱动自带OpenMPI 系统回显如图3所示,表示集群上运行IB驱动自带的OpenMPI成功。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
0rc2/tests/imb/IMB-MPI1 PingPong 图4 集群运行IB驱动自带OpenMPI 系统回显如图4所示,表示集群上运行IB驱动自带的OpenMPI成功。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图4 社区OpenMPI运行成功 回显如图4所示,表示单个BMS上运行社区OpenMPI成功。 父主题: 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景)
检查MPI环境变量 在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 假设hello.c文件在“/home/rhel/”目录下,生成的可执行文件名为hello,执行以下命令: $ cd /home/rhel/ $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上通过Spectrum
hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图4 社区OpenMPI运行成功 回显如图4所示,表示单个BMS上运行社区OpenMPI成功。 父主题: 安装和使用MPI(X86
执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图3 在单个BMS上运行MPICH 父主题:
在HPC集群上运行社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行社区MPI应用(3.1.1版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。
在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行IB驱动自带的MPI应用(3.0.0rc6版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本3.1.0rc2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
unset MPI_REMSH 执行以下命令,查看环境变量导入是否成功。 # which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 执行以下命令,编辑文件。 # cd # vi hello.c 编辑内容如下: #include<mpi
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节操作指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本4.0.2a1为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。