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使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 使用AutoGenome镜像 genomeagent镜像 父主题： 用户指南（基因平台）
Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境，里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。EIHealth平台使用容器镜像服务（Software Repository for Container，简称
为防止资源滥用，平台限定了各服务资源的配额，对用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要，您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”，查看配额。 图1 配额管理 父主题： 用户指南（基因平台）
作业管理 作业管理简介 创建作业 管理作业 查看执行结果 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
AI模型 创建模型 盘古辅助制药平台支持用户创建AI模型，目前AI模型只有专业版支持。AI建模支持创建属性模型和基模型。创建属性模型是基于自定义数据，对盘古药物分子大模型进行微调，进行属性预测和迭代活性优化，实现干湿实验闭环。基模型基于自定义化合物数据，对盘古药物分子大模型进行增量预训练，提升化合物表征精度。
镜像管理 镜像管理简介 导入或上传镜像 安装容器引擎 获取镜像 制作Docker镜像 上传镜像到SWR镜像仓库 发布镜像 父主题： 用户指南（基因平台）
发布应用 编辑应用 创建FastQC应用样例 新建流程 流程设计器 导入流程 上传流程 发布流程 添加分类标签 下载应用或流程 父主题： 用户指南（基因平台）
作业管理 分析作业管理简介 创建分析作业 创建自动作业 查看执行结果 作业执行失败排查思路 父主题： 用户指南（基因平台）
系统设置 用户管理 资源中心 标签管理 个人设置 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
导入应用 导入应用是将隶属于其他项目的应用导入至本项目中，一次至多导入50个应用。 使用“导入应用”功能，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入应用”，进入导入应用页面。 图1 导入应用 选择需要引用的项目以及项目中的应用，选择应用的版本。“
安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装，安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
有管理员用户可进行操作。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”，设置邮件配置。 服务器地址：邮箱开通SMTP功能时的服务器地址，不同邮箱开通SMTP方式不同，请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址：填写邮箱地址，用于发送EIHealth平台的消息通知。 用户名：邮箱的用户名，如果未修改过，默认为邮箱地址。
数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题： 用户指南（基因平台）
功能模块 靶点发现 苗头化合物发现 先导化合物优化 通用工具 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
准备工作 购买服务 购买资源 购买CSS资源 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
个人设置 在平台右上角用户名中选择“个人设置”，可以修改邮箱、手机号和密码。最终租户仅可修改邮箱和手机号，子用户可以修改可以修改邮箱、手机号和密码。 图1 修改个人信息 父主题： 系统设置
新建流程 选择“工具>Nextflow”，单击“新建流程”。 填写流程基本信息。 名称：设置流程名称。名称长度为1-56，只允许出现中划线、下划线、字母和数字。 标签：选择流程标签，最多可添加5个。 描述：设置流程相关描述。 单击“下一步”，添加流程文件。 单击“流程文件”后面的“添加”，添加流程文件。
管理作业 作业状态 运行中：作业创建成功，执行中。可单击作业名称，进入详情页查看运行详情。“运行中”的作业允许取消、克隆。 失败：作业运行失败。可单击作业名称，进入详情页查看运行失败原因。失败的作业允许重试、删除、克隆。 成功：作业运行成功。可单击作业名称，进入详情页查看运行详情。成功的作业允许删除、克隆。
output_dir: # 流程的当前工作目录，默认为根目录，用户可显示指定，必须以/开头，结尾不能有/。 tasks:
参数类型。取值：[STRING，FILE，DIRECTORY，ENUM] pattern: '*.fastq' # 提示用户参数填写的格式，取值范围：[0-64]。对于STRING类型，匹配字符串内容，比如后缀约束.fastq；
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