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流程设计器 分析流程至少由一个应用构成，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流，一个应用的输出作为另一个应用的输入。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器，您可以拖拽工具到画布中，可视化链接各应用，指定应用的先后顺序。 流程设计器界面 流
对于dag， timeline， report,，trace配置，医疗智能体（EIHealth）平台会默认开启并且指定相关路径，会覆盖用户侧配置，可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing
镜像管理简介 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理，
归档数据 平台支持数据的归档机制，您可以将核心数据进行归档，避免误删造成损失。 在“数据”页面单击“归档”，进入归档数据页面。 图1 选择归档 填写归档的参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型
错误码（医疗智能体与盘古辅助制药平台） 当您调用API时，如果遇到“APIGW”开头的错误码，请参见API网关错误码进行处理。 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.01040001 Invalid template content. 检查模板内容是否符合格式要求。
上传大于1GB数据 当数据过大，或者数据处于服务器上时，页面传输并不是很方便，所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令，将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
以用户组的方式导入时，用户组里已经导入到平台的用户，不算统计个数。例如，用户组A里50个用户，10个已经导入平台， 那么统计时，只会显示已选择40个用户。 IAM平台限制一个IAM用户不能加入超过10个用户组，而导入时还会再加入医疗用户组。如果IAM用户在导入平台之前就已经加入了10个用户组，则导入的时候会失败。
工具管理简介 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像，并将镜像上传至EIHealth平台，通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用，也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”页面
步骤5：下载数据 清理历史命令 前提条件 获取认证信息（AK/SK，区域名称，平台ID）。 步骤1：下载eihealth-toolkit 针对不同操作系统，eihealth-toolkit下载地址如下所示。 表1 下载列表 支持平台 下载地址 Windows 64位 health-windows-x86_64
用户管理介绍 EIHealth平台支持两种类型的用户管理，可以帮助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环
发等工作中发挥着不可替代的基础性的作用；也将支撑病毒溯源、变异进化、致病机理等研究工作。华为云联合多家科研单位，推出基因组自动化鉴定云平台。该平台直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据，具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能，实现了对样本中可能存在的包括新型冠状病毒
任务目标goal_description，提供自然语言表述的生信任务目的 # 相关信息meta，可以提供额外信息给模型辅助完成任务，相关参数：GenomeAgent(use_meta=True)即可纳入meta信息给模型， 默认为False，不采用meta信息。 config_data = { # 必须，描述数据路径和数据含义
Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。
快照方式制作镜像示例： 本示例中使用华为云弹性云服务器服务（ECS）创建一台云服务器，并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后，在云服务器列表页，选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”，输入ECS初始账号，登录ECS。 图1 云服务器列表 安装容器引擎。 启动一个空白的基础容器，并进入容器。
准备工作 购买服务 购买存储套餐包 购买系统资源 获取认证信息 父主题： 用户指南（基因平台）
自定义镜像：当提供的镜像无法满足您的需求时，可以使用自己制作的Notebook镜像。镜像制作方法请参见镜像管理。制作Notebook自定义镜像时，需要依赖平台提供的基础镜像，获取地址请参见获取镜像。 CPU 设置CPU大小。 取值范围：1~128，默认为1。 GPU 设置GPU大小。 取值范围：0~16，默认为0。
ken。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 server 是 String 服务器地址 最小长度：1 最大长度：128 subject_prefix 否 String 展示名 最小长度：0 最大长度：128 user_name
server String 服务器地址 subject_prefix String 展示名 user_name String 用户名 email String 邮箱 language String 语言类型 枚举值： en_us zh_cn 请求示例 获取邮箱配置信息 https://eihealth
除”，移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面，可以重置用户的邮箱、手机号和密码信息。在用户操作列，单击“安全设置”，重置用户的相关信息。 图3 重置用户信息 配额设置 您可以对用户管理中的某个用户设置配额。在用户操作列，单击“配额设置”，设置用户资源配额。 图4
在云服务订单页面，单击“确认付款”。 购买成功后，可以在“套餐包”页面查看套餐包信息。 资源包到期后，按需资源不会自动关闭，将会以按需付费的方式继续使用。 超出套餐包部分的用量，将会按需收费。 若平台先到期，套餐包还没到期，则不退套餐包剩余的费用。如果平台续费成功后，套餐包可以继续使用。 资源包不能抵扣已经产生的用量。
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