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镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
Boolean 是否包含值域下限 upper Number 值域上限 upper_inclusive Boolean 是否包含值域上限 请求示例 查询一个CPI任务 GET https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/cpi/{task_id} 响应示例 状态码：
upper 否 Number 值域上限 upper_inclusive 否 Boolean 是否包含值域上限 响应参数 无 请求示例 创建一个分子生成任务 { "num_trials" : 10000, "weak_constraints" : [ { "name"
upper 否 Number 值域上限 upper_inclusive 否 Boolean 是否包含值域上限 响应参数 无 请求示例 创建一个CPI任务 POST https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/cpi { "header" :
upper 否 Number 值域上限 upper_inclusive 否 Boolean 是否包含值域上限 响应参数 无 请求示例 创建一个分子优化任务 POST https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/optimization {
Boolean 是否包含值域下限 upper Number 值域上限 upper_inclusive Boolean 是否包含值域上限 请求示例 查询一个分子生成任务 GET https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/generation/{task_id}
搜索使用到的数据库集合 top_n 否 Integer 期望最大返回条目数（排序后取Top） 最小值：1 最大值：1000 响应参数 无 请求示例 创建一个分子搜索任务 { "smiles" : "c1ccccc1", "databases" : [ "drug_space_x", "drug_bank"
参数类型 描述 name String 评估指标的名称 最小长度：1 最大长度：32 value Float 评估指标的评估结果 请求示例 查询一个自定义属性 GET https://{endpoint}/v1/{project_id}/custom-props/{task_id} 响应示例
Boolean 是否包含值域下限 upper Number 值域上限 upper_inclusive Boolean 是否包含值域上限 请求示例 预测一个分子的ADMET属性 { "smiles" : "c1ccccc1", "custom_props" : [ { "id"
如何调用API 开通服务 构造请求 认证鉴权 返回结果
基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能，通过获取示例数据，创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义，流程至少由一个应用组成。 您可以使用该工具创建流程，并进行修改、删除、查询、导入操作。对于由多个应用构成的流程，可通过设置不同应用的输入、输出关系搭建为流程。 作业管理 您可以使用该工具启动分析作业，并进行查询、删除、重试、取消操作。
ok”区域下，选择适用的AI引擎，单击后将新建一个对应框架的Notebook文件。 由于每个Notebook实例选择的工作环境不同，其支持的AI框架也不同，下图仅为示例，请根据实际显示界面选择AI框架。 图3 选择AI引擎并新建一个Notebook 新建的Notebook文件将呈现在左侧菜单栏中。
科研单位 平台以流程管理及Notebook为核心，内置了常见的基因组数据分析流程，科研工作者可以非常方便的实现数据管理，开发自己的分析流程，分享自己的数据分析流程，以及复现业内已有的流程。
max_prediction_per_product 是 Integer 每个产物的最大反应数量 最小值：2 最大值：20 响应参数 无 请求示例 创建一个分子合成路径规划任务 POST https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/synthesis {
Array of strings 分子合成规划，列表内是reactions id score Float 当前分子合成路径的得分 请求示例 查询一个分子合成路径规划任务 GET https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/synthesis/{task_id}
Docking。DSDP是由北大高毅勤团队研发的基于GPU加速的对接方法，支持全局对接。 如果对接引擎选择Similar Docking，不需设置口袋信息，但需要为每一个靶点上传一个“模板配体文件”。 配置受体口袋位置，如果包含多个受体文件，需要每个受体都进行口袋设置，才能单击提交。 原始配体 将原始配体作为口袋
"error_code": "AS.0001" } 其中，error_code表示错误码，error_msg表示错误描述信息。 父主题： 如何调用API
上传大于1GB数据 当数据过大，或者数据处于服务器上时，页面传输并不是很方便，所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令，将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
药物虚拟筛选平台的输入数据，需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求，将数据上传至项目中。 输入蛋白质，pdb格式，将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子，配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串，第二列为smiles名称，中间用tab键分割。
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