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内置大量生物医疗领域标准分析流程,并结合华为特有的高性能云计算,多样性算力,大数据等技术加速计算过程。 支持十亿节点、百亿边的超大规模图数据库查询,提供适用于基因和生物网络数据的图深度学习算法。 拥有基于基因组数据自动深度学习的技术框架AutoGenome,深度融合人工智能技术,产生更加便捷、快速、准确、可解
在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。 单击“绑定”进入绑定界面,选择要绑定的CSS集群名称、填写管理员账户名和管理员密码。 单击“测试链接”验证用户名或密码无误后单击“确定”,即可完成绑定(可选项)。您也可以单击操作列的“解除绑定”来解除当前的绑定。 图1 绑定CSS资源入口
流程参数列表文件,取值范围[0, 10M] 响应参数 无 请求示例 更新Nextflow流程,修改流程描述为description,标签为labelA,labelB,流程主文件为main.nf https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
在该目录中创建一个空白文件abc.txt,创建一个webapp目录。 touch abc.txt mkdir webapp 在该目录中下载一个网络图片。 wget https://www.baidu.com/img/bd_logo1.png 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。
使用命令行工具下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health
完整描述文本 labels: # 可选 # 标签 - labelA - labelB timeout: 1440 # 可选 # 流程超时时间,取值范围[1,144000],单位分钟,默认1440
具有高性能、模块化等特性,是一个完全自主研发的分子模拟软件库。基于高毅勤教授课题组和华为团队的技术支持,已经实现自由能微扰加速10倍以上。测试 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
该命令不支持将数据上传到引用目录。 最小可以上传0Byte的空文件或文件夹,最大可以上传48.8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
"labels" : [ { "id" : "id", "name" : "label1", "description" : "测试标签", "creator" : "user1", "create_time" : "2021-02-01T14:25:34Z"
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能? 如何将Notebook中的数据下载至本地? 如何在Notebook中安装外部库?
提供了友好、便捷的操作体验,但是当面临大批量的测序数据时,需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率,本章节介绍如何通过循环读取输入数据,批量运行NGS。同时,您也可以参考本示例,将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。 配置命令行工具 批量执行分析需要
是-2^1024 ~ +2^1024,也即-1.79E+308 ~ +1.79E+308。超出精度返回会保留小数点后16位的精度。 图1 测试数据 图2 创建数据库 导入数据 数据库创建好以后,您可以参照数据库模板格式,将已有的数据进行导入。 单击数据库右上角“导入数据”。 图3
完整描述文本 labels: # 可选 # 标签 - labelA - labelB image: 'xxxx' # 必选 # 镜像地址 commands:
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置? 直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
镜像 如何搭建Docker环境? 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传?
project -d "详细描述" -s "简要描述" -o "/data/output" -t 2000 -l "labelA;labelB" # 返回结果如下 edit workflow succeed! 父主题: EIHealth流程管理命令
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