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如何将Notebook中的数据下载至本地 在Notebook页面,可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。当在Notebook中上传文件提示大小受限时,您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
如何将生物信息学软件封装为镜像并上传 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例,帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检查工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成后
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
AK/SK签名认证方式仅支持消息体大小12MB以内,12MB以上的请求请使用Token认证。 AK/SK认证就是使用AK/SK对请求进行签名,在请求时将签名信息添加到消息头,从而通过身份认证。 AK(Access Key ID):访问密钥ID。与私有访问密钥关联的唯一标识符;访问密钥ID和私有访问密钥一起使用,对请求进行加密签名。
常见问题 了解更多常见问题、案例和解决方案 热门案例 AK/SK是什么?如何获取AK/SK 如何搭建Docker环境? 如何制作镜像? 如何将生物信息学软件封装为镜像? 更多 远程登录 应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程 步骤1:对应用进行分析 步骤2:准备应用运行环境 步骤2:准备应用运行环境
如果是相对路径,必须是相对于Dockerfile所在目录的相对路径。 如果是URL,会将文件先下载下来,然后再添加到镜像里。 第二个参数:目标路径。 如果源文件是主机上的zip或者tar形式的压缩文件,Docker会先解压缩,然后将文件添加到镜像的指定位置。 如果源文件是一个通过URL指定的网络压缩文件,则不会解压。
附加请求头字段,如指定的URI和HTTP方法所要求的字段。例如定义消息体类型的请求头“Content-Type”,请求鉴权信息等。 如下公共消息头需要添加到请求中。 表3 公共请求消息头 参数名 说明 是否必选 示例 Content-type 消息体的类型(格式),默认取值为“application/json”。
&& rm fastqc_v0.11.5.zip \ && chmod +x /FastQC/fastqc # 将FastQC添加到环境变量中 ENV PATH "/FastQC:$PATH" 按键盘Esc键,并执行:wq保存退出Dockerfile。 制作镜像。 docker
当前python进程工作目录下能访问;以及提供自然语言表述的数据含义。 # 任务目标goal_description,提供自然语言表述的生信任务目的 # 相关信息meta,可以提供额外信息给模型辅助完成任务,相关参数:GenomeAgent(use_meta=True)即可纳入meta信息给模型,
更新或者添加项目成员角色 功能介绍 更新或者添加项目成员角色 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI PUT /v1/{project_id}/eihealt
获取节点标签集 功能介绍 获取节点标签集 URI GET /v1/{project_id}/system/cluster/labels 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
添加收藏 功能介绍 添加收藏。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/favorites 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
获取节点标签集 功能介绍 获取节点标签集 URI GET /v1/{project_id}/system/nodes/{server_id}/labels 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
获取节点剩余配额 功能介绍 获取节点剩余配额 URI GET /v1/{project_id}/system/computing-resources/quota 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
设置节点标签 功能介绍 设置节点标签 URI POST /v1/{project_id}/system/nodes/{server_id}/labels 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
获取策略关联计算资源列表 功能介绍 获取策略关联计算资源列表 URI GET /v1/{project_id}/system/autoscaler/scale-out-policies/{id}/computing-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述
获取预置标签列表 功能介绍 获取预置标签列表 URI GET /v1/{project_id}/system/preset-labels 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
查询计算资源调度信息 功能介绍 查询计算资源调度信息 URI GET /v1/{project_id}/system/computing-resources/{id}/schedule 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。