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在“数据中心”页面，使用“复制”，将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击页面右上角“复制”。 图1 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹，以及数据存储路径，单击“确认”，复制数据。 例如，将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。 图2
块。 图1 新建作业 单击“确定”，在对应的模块页面配置详细信息，具体请参考功能模块。 克隆作业 克隆已有的作业，作业的参数及流程一并克隆到新作业中。 在“作业中心”页面，单击作业操作列的“克隆”。 在作业详情页面修改对应的参数信息。 参数确认无误后，单击“提交”按钮。 父主题：
下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构 health switch project <project-name> # 命令示例，例如进入到名为eihealth-user-project的项目中 health switch
被优先执行。默认值为0。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用和作业都配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在
评估测序的Reads数目，测序Base数，测序深度等。 低质量Reads过滤 过滤低质量的测序Reads，得到Clean Reads。 基因组比对 将Clean Reads比对到参考基因组上，同时输出比对率、深度、覆盖度的统计信息。 基因组变异检测 基于上述比对得到的bam文件，通过GATK4做Variant Calling，输出变异检测结果。
下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构 health switch project <project-name> # 命令示例，例如进入到名为eihealth-user-project的项目中 health switch
行，不会按照优先级进行运行。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的
9”，如果选择Snt9，GPU需求需要是0、1、2、4、8。 GPU需求：请按实际需求填写，只能输入0到16的正整数。 计算节点标签：请选择标签名称，不支持多选。应用将会调度到有相应节点标签的计算节点。计算节点标签设置方法请参见计算资源标签管理。 图4 CPU、内存、GPU 填写输入参数、输出参数。
行，不会按照优先级进行运行。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的
行，不会按照优先级进行运行。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的
在“数据”页面，使用“复制”，将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击“复制”。 图2 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹，以及数据存储路径，单击“确认”，复制数据。 例如，将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。 图3 复制数据
应用程序及其依赖文件。 项目 项目是EIHealth平台的一个工作空间，可以在项目中存储数据，上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中，并通过划分角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。
fastqc命令进行搜索镜像。 若dockerhub上没有想要的镜像，可以利用基础的操作系统镜像进行构造，构造方式请参见用户指南。 选择和获取镜像。 搜索到的镜像列表中选择一个fastqc镜像进行pull，这里我们选择pegi3s/fastqc。 pull镜像。 若该镜像没有lastest版本则需进入dockerhub官网进行查询。
步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节介绍如何通过循环读取输入数据，批量运行NGS。同时，您也可以参考本示例，将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。 配置命令行工具 批量执行分析需要通过命令行工具完成。请参考配置命令行工具章节，下载命令行工具并完成配置。 获取NGS作业配置文件
状态码： 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 复制项目数据，使用覆盖模式，复制到目标目录为test。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_i
习算法及药物分析服务融入药物研发过程，让药企能更快速高效地完成药物研发，节约研发成本。 产品优势 提供开放的、易于扩展的平台架构。 提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产，提升企业的效率。 内置大量生物医疗
biocontainers/fastp:v0.20.1_cv1 Mapping and Sort and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 bwa-mem:0.7.17 该镜像由bwa和samtool合并而成，镜像制作方法请参见制作bwa-mem镜像。 Insert
导入用户时不能超出配额。如果超出配额，进行配额调整后，5分钟后生效。 以用户组的方式导入时，若超出配额的部分会导入失败。 以用户组的方式导入时，用户组里已经导入到平台的用户，不算统计个数。例如，用户组A里50个用户，10个已经导入平台， 那么统计时，只会显示已选择40个用户。 IAM平台限制一个IAM
口袋发现时长：默认值为50ns，输入范围：20-50。 表面原子离散点数量：每个表面原子离散点数量。默认值为20，输入范围: 10-50。 探针半径：控制产生的离散点到表面原子的距离。默认值为1.4 ，输入范围: 1.4-5，单位：Å。 名称：可修改，修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符；仅可以使用
导入用户时不能超出配额。如果超出配额，进行配额调整后，5分钟后生效。 以用户组的方式导入时，若超出配额的部分会导入失败。 以用户组的方式导入时，用户组里已经导入到平台的用户，不算统计个数。例如，用户组A里50个用户，10个已经导入平台， 那么统计时，只会显示已选择40个用户。 IAM平台限制一个IAM
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