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参数类型 描述 time String 事件产生时间 name String 事件名称 event_type String 事件类型 请求示例 查询伸缩事件列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/
名称,支持computing、performance、database、storage,分别代表计算资源、性能加速资源、数据库资源和存储资源。 --action -a 否 查询计算节点方式。 取值范围: get-labels:获取计算资源标签列表。get-labels要和--node一起组合使用。 list:获取计算资源列表。
步骤3:创建分析作业 步骤4:查看执行结果 步骤1:订阅流程 使用RNA-Seq流程前,需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“RNA-Seq Analysis Based on STAR”流程。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。
提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产,提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程,并结合华为特有的高性能云计算,多样性算力,大数据等技术加速计算过程。 支持十亿节点、百亿边的超大规模图数据库查询,提供适用于基因和生物网络数据的图深度学习算法。
数据上传方法请参见“数据”页面上传。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealth平台,提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用,支持上传最大为48.8TB的单个文件。 数据上传方法请参见命令行工具概述。 父主题: 数据管理
进入资产市场,分别订阅fasp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。 图2 查看订阅的应用 步骤2:新建流程 在“工具 > 流程”页面,单击“新建流程”按钮,填写流程名称,版本等信息。 图3 新建流程 利用拖拽的
切换到引用数据的路径,例如引用了gene-assent项目中的DataSet数据,使用health cd命令切换到该路径,并使用health ls名称查看详细数据。 当由引用数据的路径,切换到自己项目数据时,需指明具体的路径。 health cd gene-assent:/DataSet/ health
k、流程管理等,但无项目分享等权限。 上传者 项目数据上传者,可通过EIHealth平台或命令行工具上传数据。无法执行流程和Notebook等操作。 观看者 项目查看人员仅具备项目查看权限,无项目操作权限。 表2 角色权限 成员角色 所有者 管理员 开发者 上传者 观看者 项目管理
响应Body参数 参数 参数类型 描述 total Integer 总配额 usage Integer 已使用 unit String 单位 请求示例 查询evs配额及使用情况 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_
从其他项目导入的镜像,在镜像列表“源项目”列中,显示所属的项目。 客户端上传镜像 使用命令行工具eihealth-toolkit上传镜像,详细的上传过程请参见上传镜像到SWR镜像仓库,详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 父主题: 镜像管理
基于流程ID创建分析作业,可使用health get workflow workflow-name:version:srcproject命令查询流程ID,srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --yaml和--workflow命令不能同时存在。
作业名称”,进入作业在输出结果页面查看。 图1 查看分子对接结果 在输出结果右侧的配体展示列表中,可以单击需要收藏的配体卡片右上方的进行收藏(在3D视图下),收藏配体列表前两位的配体。 单击页面右上角的“只看收藏”,页面筛选出收藏的配体。如果查看全部配体,单击页面右上角的“查看全部”,出现全部配体。
强制操作,不进行询问提示。 批量移动时该参数可选。 --jobs -j 否 批量移动时的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。 批量移动时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式,如:*.txt。批量移动时该参数可选。
待恢复上传任务结果清单文件的任务号。 任务号(TaskId)可在每次上传任务运行完毕后获取,或者通过结果清单文件名查询(文件名除去后缀.txt后的后36位)。 待恢复的上传任务会从结果清单的文件夹中查找,结果清单文件夹的路径参考附加参数--o。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealt
步。 表1 上传数据方法 上传方法 说明 “数据”页面上传 通过“数据”页面上传数据,支持上传最大为1GB的单个文件。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealth平台,提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用,支持上传最大为48.8TB的单个文件。
记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 同步上传文件夹时批量任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。 同步文件夹时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含文件的匹配模式,如:*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“
功能模块 靶点发现 苗头化合物发现 先导化合物优化 通用工具 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
若当前所在目录为src2,新增子目录dataset。 health mkdir dataset # 创建成功不进行提示,可以使用health ls命令查看目录 父主题: 数据管理命令
响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 节点总数 nodes Array of strings 节点列表 请求示例 查询对应扩容策略下的节点列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{projec
单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果,输出结果缩略图。 图2 查看运行结果(1) 单击查看路径,查看输出结果详情。 可以单击左上角“下载”,下载当前的输出结果。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 图3 查看运行结果(2)