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约束方式,包含“区间”,“最大化”和“最小化”种方式,“区间”指的是我们所选择的属性包含在我们所设置的参数设置区间内。
EIHealth中的流程由应用搭建形成,应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义,包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。 单击参数名称,可查看参数的详细信息。 单击输入参数图标,可指定输入数据路径。
对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values Array
3 8 CONECT 5 1 6 8 CONECT 6 2 5 7 CONECT 7 3 6 8 CONECT 8 4 5 7 状态码 状态码 描述 200 生成的口袋字符串
wchar Long 写入字符数 read_bytes Long 读取字节数 write_bytes Long 写入字符数 vmem Long process虚拟内存大小 rss Long process实际内存大小 peak_vmem Long process虚拟内存峰值 peak_rss
{ "x_coord_list" : [ 0.1, 0.2, 0.3 ], "y_coord_list" : [ 0.1, 0.2, 0.3 ], "z_coord_list" : [ 0.1, 0.2, 0.3 ] } 响应示例 状态码: 200 表面离散点生成的字符串结果
最小长度:1 最大长度:56 description 否 String 流程描述 取值范围[0,65535] 最小长度:0 最大长度:65535 labels 否 Array of strings 流程标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、
也可以下载输出结果文件包含小分子的基本信息和属性。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 图6 查看结果(1) 图7 查看结果(2) 图8 查看结果(3) 单击查看全部展示收敛性分析、RMSF和RMSD结果。 图9 查看结果(4) 单击查看轨迹预览轨迹动图。
镜像启动命令支持多行输入,每行最多256字符,最多支持300行。 例如,bamqc软件输入参数填写为genomedir、thread和input,输出参数为outputdir,则镜像启动命令如下所示。
如果路径中带有特殊字符比如()之类的,运行的时候需要将整个路径用""括起来,或者用\将字符转义,例如:health cp "/src2/abs(1).txt" /src1/ 或者 health cp /src2/abs\(1\).txt /src1/ 。
更改输入文本为字符串类型。 400 eihealth.03011002 Input key error. 更改关键字为“text”。 400 eihealth.03011003 Text length error. 输入文本长度需在1-256之间。
相关参数 物化性质(Physicochemical Property) Molecular Weight (MW): 分子量大小,包含氢原子,最佳分子量在100~600之间。 Molecular Refractivity (MR): 总极化率,取决于分子的温度、折射率和压力。
最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 labels 否 Array of strings 标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者尾。
} }, "ligand" : { "source" : "EXTRANET", "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb" } } 响应示例 状态码: 200 蛋白小分子拼接复合物结果字符串
name String 作业的名称,取值范围:[1,63],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。
最小长度:5 最大长度:64 labels 否 Array of strings 标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。
(-) description String 自动作业的描述, 取值范围:输入字符最大长度为255 labels Array of strings 自动作业标签 priority Integer 自动作业优先级,[0,9],0表示最低,默认0 timeout Integer 作业执行超时时长
node_labels: # 计算节点标签 标签个数取值范围[0-1],单个节点标签最大长度56个字符,以字母或数字开头,可以包含下划线(_)、中划线(-)、点(.)
长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格,首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果。
生成相互作用2D图 功能介绍 生成相互作用2D图,若不提供配体文件,则受体文件中必须包含配体;若提供配体文件,则受体中的配体(若有)则会被忽略。