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图1 创建文件系统 2.在"创建文件系统"界面的"文件系统类型"选项中,根据业务需要,选择"HPC型"或"HPC缓存型"文件系统类型。 图2 选择文件系统类型 3.在"创建文件系统"界面的"选择网络"选项中,需注意与购买的弹性云服务器选择相同的网络配置。 4.在"创建文件系统"界面的
验证MPI运行在RoCE网络上 执行以下命令,安装iproute2。 yum -y install iproute* 执行以下命令,查看RoCE上是否有流量。 rdma res show 若MPI运行中,回显结果中qp 数量较大(大于1),则证明运行在 RoCE 网络上: 无业务时
提供按需扩展的高性能文件存储。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 6 虚拟私有云(VPC) 为云服务器等云上资源构建隔离、私密的虚拟网络环境。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘(EVS) 为ECS、BMS等计算服务提供持久性块存储的服务。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。
nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens nfs vers=3,timeo=600,nolock
unset MPI_REMSH 执行以下命令,查看环境变量导入是否成功。 # which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 执行以下命令,编辑文件。 # cd # vi hello.c 编辑内容如下: #include<mpi
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
配置BMS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。
3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2 查看MPI环境变量 系统回显结果如图2所示,则环境配置正常。 执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel MPI benchmark。 # mpirun --allow-run-as-root -np 2 /usr/mpi/gcc/openmpi-3
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
科研周期。 使用灵活 在镜像模板中预制MPI库、编译库及优化配置,加快环境部署。 企业分支、科研组织机构等跨全球地理位置进行及时协同工作,提高效率。 可以利用公有云的跨地域能力,共享计算资源,海量数据,并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优
LDFLAGS="-L/usr/lib64" CPPFLAGS="-I/usr/include" make make install Udapl配置修改 在/etc/dat.conf首行(放在末尾运行STAR-CCM+会有异常)加入如下配置。 ofa-v2-cma-roe-enp177s0 u2
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图3 在单个BMS上运行MPICH 父主题:
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图4 社区OpenMPI运行成功 回显如图4所示,表示单个BMS上运行社区OpenMPI成功。 父主题: 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景)
检查MPI环境变量 在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 假设hello.c文件在“/home/rhel/”目录下,生成的可执行文件名为hello,执行以下命令: $ cd /home/rhel/ $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上通过Spectrum
执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 检查环境变量 在单个BMS上运行Platform MPI。 执行以下命令,重新编译hello.c文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Platform MPI。 $ mpirun -np
hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图4 社区OpenMPI运行成功 回显如图4所示,表示单个BMS上运行社区OpenMPI成功。 父主题: 安装和使用MPI(X86