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11.5.2。“短描述”、“描述”、“标签”可选填。 图2 填写基本信息 选择镜像。 单击“选择镜像”,在“自定义镜像”列表中选择fastqc镜像和镜像版本。 依据FastQC命令说明填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量,并以大括号扩起,以$符号进行引用。
是 String 镜像资产ID 最小长度:1 最大长度:128 version 是 String 镜像资产版本 最小长度:1 最大长度:128 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 镜像id 请求示例 订阅镜像,选取指定资产和版本订阅
镜像管理 发布镜像 导入镜像 订阅镜像 更新镜像描述信息或者类型 删除镜像仓库 批量删除镜像tag 删除指定镜像tag 获取镜像列表 创建镜像 获取docker login指令 获取指定镜像的tag列表 父主题: 项目管理
镜像管理 镜像管理简介 导入或上传镜像 安装容器引擎 获取镜像 制作Docker镜像 上传镜像到SWR镜像仓库 发布镜像 父主题: 用户指南(基因平台)
删除镜像仓库 功能介绍 删除镜像仓库 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-project
Integer 镜像总数 images Array of ImageDetailRsp objects 镜像详情列表 表5 ImageDetailRsp 参数 参数类型 描述 name String 镜像名称 id String 镜像ID type String 镜像类型 chip_type
批量删除镜像tag 功能介绍 批量删除镜像tag 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-pro
更新镜像描述信息或者类型 功能介绍 更新镜像描述信息或者类型 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI PUT /v1/{project_id}/eihealt
删除指定镜像tag 功能介绍 删除指定镜像tag 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-p
cvrseq-variantqc应用构成。在创建应用前,请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0
方式3:自定义镜像运行FastQC流程 应用是运行作业的最小单位,每个应用依托于一个镜像进行创建。 方式2使用直接制作好的应用。用户也可以自己制作镜像,并基于镜像创建应用。 本示例中制作FastQC镜像,并基于镜像创建应用,运行分析作业。 镜像简介 由于生物信息学软件,往往由于不
count Integer 镜像版本总数 tags Array of GetTagDetailRsp objects 镜像版本详情列表 表4 GetTagDetailRsp 参数 参数类型 描述 tag String 镜像版本名称 size Long 镜像版本大小 create_time
-fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 容器镜像服务支持使用容器引擎1.11.2及以上版本上传镜像。 父主题: 镜像管理
详细的创建应用过程、镜像填写方法、参数填写方法,请参考创建应用样例章节。 单击“新建应用”,进入新建应用页面。 图1 新建应用 填写应用的基本信息,包括“名称”、“版本”、“图标”、“标签”、“短描述”和“描述”。 图2 基本信息 选择镜像和镜像版本。 详细的镜像介绍和制作方法请参见镜像管理。
File 文件流对象 name 是 String 供应商名称 最小长度:1 最大长度:30 响应参数 无 请求示例 设置供应商配置,设置名称,上传图片 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/vendor-config
最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 login_cmd String 临时登录指令 请求示例 查询镜像仓库登录指令 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/
”。一般私密数据不建议用此方法。 目前仅支持访问用户个人OBS下的链接,不支持读取其他用户公共读的链接。 上传待检测的图片 请参见OBS文档上传对象。 获取图片URL 请参见OBS文档获取对象URL。 父主题: 附录
获取供应商logo和名称设置 使用get命令获取供应商logo和名称配置,默认将供应商logo图片下载到本地路径。 命令结构 health get vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc 命令示例 本节以Windows为例介绍e
EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像,并将镜像上传至EIHealth平台,通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”页面“工具”页签中,
yter Notebook的下一代产品,可以使用它编写Notebook、操作终端、编辑MarkDown文本、打开交互模式、查看csv文件及图片等功能。 可以说,JupyterLab是开发者们下一阶段更主流的开发环境。JupyterLab支持更加灵活和更加强大的项目操作方式,但具有和Jupyter