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功能模块 靶点发现 苗头化合物发现 先导化合物优化 通用工具 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
如何使用Notebook的Terminal功能 对于习惯编码的开发者可以使用Terminal功能进行开发、调试和运行分析任务。 在“Files”页签下，单击右上角“Open JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。
genomeagent镜像功能点介绍 此章节介绍genomeagent镜像的基本功能。 功能点1：自动生成任务计划、自动生成子步骤代码 功能点2：自动提交EIFlow代码任务 功能点3：报错时自动修正 报错时自动修正 报错时用户介入修正。
获取供应商logo和名称设置 使用get命令获取供应商logo和名称配置，默认将供应商logo图片下载到本地路径。
上传待检测的图片 请参见OBS文档上传对象。 获取图片URL 请参见OBS文档获取对象URL。 父主题： 附录
JupyterLab简介及常用操作 JupyterLab是一个交互式的开发环境，是Jupyter Notebook的下一代产品，可以使用它编写Notebook、操作终端、编辑MarkDown文本、打开交互模式、查看csv文件及图片等功能。
苗头化合物发现 分子对接 分子属性预测 分子搜索 CPI预测 分子生成 父主题： 功能模块
通用工具 MOL 3D Viewer MOL Editor 聚类分析 父主题： 功能模块
结果页面支持对生成分子进行查看详情、查看3D结构、下游分析（分子优化及合成路径分析）、与原始分子属性对比（仅支持片段优化的属性对比）、查看分子与靶点的2D相互作用、下载2D相互作用图片，下载3D分子结构、收藏结果等多项功能。 支持按照相互作用力进行高级筛选，单击进行条件配置。
导出不同分辨率的图片文件。 播放与制作分子动力学轨迹动画。 父主题： 通用工具
功能调用消耗：运行一次功能会消耗一次。 图2 设置靶点优化MD配置页面 查看靶点优化结果 单击作业名称，进入作业结果页面，拟时结果根据构象RMSD聚类。 单击“查看轨迹”，下载运动轨迹。 单击“下游分析”，将聚类之后的不同构象进行分子对接。
靶点发现 靶点口袋发现 靶点优化 父主题： 功能模块
功能调用消耗：运行一次功能会消耗一次。 生成后的小分子在满足强约束条件的基础上，会根据满足弱约束条件的权重总和以及与参考小分子的相似度来打分并进行排序。在初始化权重的基础上，每个约束所占的权重，会在每一轮的分子生成迭代中，根据所满足的约束来进行动态调整。
先导化合物优化 分子优化 靶点口袋分子设计 自由能微扰 合成路径规划 父主题： 功能模块
设置供应商配置 功能介绍 设置供应商配置 URI PUT /v1/{project_id}/system/vendor-config 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。
功能调用消耗：100000个小分子记一次功能调用。 配置完成后，单击“提交”。 提交成功后，可以在“作业中心”查看执行结果。 查看多对多运行结果。 如果是多受体对多配体，打开作业结果页面可以看到结合能二维矩阵，支持分别按照靶点和小分子进行排序。
单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择可上传的分子文件。
单击“功能模块 > 通用工具 > MOL Editor”，进入Mol Editor页面即可操作。可以通过单击右上角的“保存”，将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题： 通用工具
查看2D相互作用图：查看配体中分子之间的2D相互作用图，并且可以进行图片下载。 下游分析：分子优化对应的下游分析为分子搜索、分子优化和合成路径，如果分子设置了靶点，可以选择自由能微扰进行下游分析，单击“确定”即可创建。
单击“分子对接”功能卡片，进入分子对接受体预处理页面，单击上传受体文件，进行受体蛋白预处理配置。 受体文件仅支持PDB格式，若文件中存在多个受体，默认只处理第一个。受体文件支持上传1个或者多个文件，最多支持输入20个受体文件，文件来源包含数据中心、PDB库、示例数据。
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