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流程创建完成后,可基于已创建的流程运行分析作业。 在EIHealth平台,运行分析作业的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于已获取到的模板使用命令行工具启动分析作业,运行的分析作业将同步显示到EIHealth平台。 获取作业模板 使用health get job
update app ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 可选: 应用的ID(app-id),使用命令行工具创建应用时生成。示例请参见创建应用命令示例。 应用的名称、版本、所在项目名称(app-name:version:srcproject),s
模型参数将会保留。 提取降维之后数据:完成模型训练后,生成降维后的结果数据。 当您在运行AutoGenome示例出现“Warning:restart the kernel and run the notebook again!”时,请单击Notebook工具栏中的按钮,重启Not
当数据过大,或者数据处于服务器上时,页面传输并不是很方便,所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令,将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
docker images命令查看已有的镜像。 详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 登录EIHealth平台,在镜像列表中查看已上传的镜像。 步骤4:创建应用 在“项目管理”页面“工具”页签中,单击“新建应用”。 填写应用的基本信息。 “名称”填写fastqc,“版本”填写v0
订阅Docking Summary流程 进入资产市场订阅Docking Summary流程。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 父主题: 运行大规模虚拟药筛任务
--help可以替换成任何fastqc的命令,与linux类似。 步骤2:上传镜像至EIHealth平台 配置命令行工具。 若已完成配置,可跳过此步骤。 在命令行工具所在的目录,使用switch命令进入EIHelath平台的项目中。 # 命令结构 health switch project
String 账号id 最小长度:1 最大长度:32 name String 名称 最小长度:1 最大长度:100 logo String logo图片base64编码 最小长度:0 最大长度:1500000 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "vendors" : [
最大长度:128 description 否 String 长描述 最小长度:0 最大长度:65535 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 labels 否 Array of strings 标签列表 最小长度:1 最大长度:32
Notebook提供了在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码,在创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像。同时,您也可以使用自定义镜像,创建Notebook,满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Notebook(在基础镜像中安装化学分子格式转换工具Open Babel),详细步骤如下所示:
什么是医疗智能体eihealth-toolkit 医疗智能体命令行工具(eihealth-toolkit)是配套EIHealth平台,为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具,可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。
订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2:上传待分析数据 您在使用Docking Summary流程前,请先上传待分析的数据,上传数据方法请参见数据管理。 步骤3:创建分析作业 单击项目名称,进入“项目管理”页面,并选择“工具”页签。 单击Docking S
强制操作,不进行询问提示。 批量移动时该参数可选。 --jobs -j 否 批量移动时的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。 批量移动时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式,如:*.txt。批量移动时该参数可选。
记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 同步上传文件夹时批量任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。 同步文件夹时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含文件的匹配模式,如:*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“
最小长度:1 最大长度:24 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 summary 否 String 短描述 最小长度:0 最大长度:128 description
最小长度:1 最大长度:56 version 是 String 资产版本 最小长度:1 最大长度:24 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 summary
最大长度:128 description 否 String 详细描述 最小长度:0 最大长度:65535 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 labels 否 Array of strings 标签列表 最小长度:1 最大长度:32
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”字符本身。如果待下载的对象名匹配该参数,则跳过该对象的复制。 建议使用引号传递该匹配模式(macOS/Linux操作系统使用单引号,Windows操作系统使用双引号)防止特殊符号被操作系统转义,导致不可预期的结果。该匹配模式作用于对象全路径(含从根路径开始的对象前缀和对象名,例如,桶内对象路径为obs://bucket/src1/src2/test
q文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health switch project