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最小长度:1 最大长度:64 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 summary 否 String 短描述 最小长度:0 最大长度:128 description
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter No
cd . 切换到上一级路径。 health cd .. 切换到指定的路径,如切换到src1。 health cd /src1 回到本项目根路径。 health cd / 回到本项目下DataSet路径。 health cd gene-assent:/DataSet/ 切换到引用数据
String 标签页面标题,正则匹配中文,英文字母和数字及下划线 最小长度:1 最大长度:32 feature 是 String 标签页面类型 枚举值: TOOL labels 是 Array of strings 标签页面包含的标签值,正则匹配中文,英文字母和数字及下划线 最小长度:1 最大长度:32
resource_name 是 String 收藏的资源名称,正则匹配中文,英文字母和数字及下划线。 最小长度:1 最大长度:128 resource_type 是 String 收藏的资源类型,正则匹配英文字母和数字及下划线。 最小长度:1 最大长度:128 display_info
查看结果(2) 单击“查看3D”,可以看到分子的3D构象,如果设置了靶点,还可以看到优化后的小分子与靶点的结合构象。 如果上传了双靶点,可以通过切换来切换靶点,查看相应靶点和优化后分子的结合构象。如果设置了两个靶点会默认下载两个靶点的结果。 单击配体列表的可以收藏结果,收藏后可直接在收藏夹页查看。
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
切换项目 使用switch命令切换到指定的项目中。 使用该命令前,您需要先创建项目,再使用switch命令进入该项目。 命令结构 health switch project <project-name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 是
登录盘古辅助制药平台,选择“AI模型”。 图1 AI模型 单击“创建模型”,设置相关参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 模型名称。 长度为5-32个字符,首位需以英文字母开头,仅可以使用字母、数字、下划线“_”和中划线“-”和空格。 描述 设置模型的描述信息。 基模型 设置基模型,基模型与分子描述符有关。选择不同的基模型,分子描述符不一样。
D结构、下游分析(分子优化及合成路径分析)、与原始分子属性对比(仅支持片段优化的属性对比)、查看分子与靶点的2D相互作用、下载2D相互作用图片,下载3D分子结构、收藏结果等多项功能。 支持按照相互作用力进行高级筛选,单击进行条件配置。 可以以列表的形式查看口袋分子的作业,单击“下
to pdbqt:将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf:将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt:将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w:分子对接。
和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤,进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig,根据contig下发对应的任务,并依据不同任务,指定并行下发的任务数,以降低流程整体的运行时间。 流程执行信息 NGS流程由
创建数据库”,并填写相关信息。每个用户可新建100个自定义数据库。 图1 创建数据库 名称:数据库名称。长度为5-32个字符,首位需小写英文字母开头,仅可以使用小写字母、数字、下划线“_”和中划线“-”。最终租户下的所有用户数据库名称不能重名,可以和官方数据库名称重名,不区分大小
docker镜像地址,取值范围[5-255],不能包含中文字符 commands: # docker启动时执行命令 单行命令长度取值范围[0-256],不能包含中文字符,支持多行输入,最多支持300行。 - 'echo
url获取方法 在Notebook列表页面,按F12键打开,切换至Network页签。 单击页面右侧按钮,在Network页签的“Name”列单击“notebooks?offset=0&limit=10”,右侧展开代码行,在“url”行获取url链接,如下图所示。 图1 获取url
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ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url
docker镜像地址 取值范围[5-255],不能包含中文字符 最小长度:5 最大长度:255 commands 是 Array of strings docker启动时执行命令 取值范围[1-300],单个命令长度取值范围[0-256],不能包含中文字符 最小长度:0 最大长度:256 数组长度:1
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