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查看的文件、文件夹对象。 注意: 如果为引用数据,必须要使用绝对路径(文件夹最后要加/)。未引用的数据不能查看。 --bf -b 附加参数,可选 设置是否以人方便阅读方式输出结果。取值包括:human-readable、raw。 --e -P 附加参数,可选 指定终端节点。 --i -i
约束与限制 使用区域限制 医疗智能体目前支持的区域为“华北-北京四”、“华东-上海一”、华南-广州。 盘古辅助制药平台仅在“华东-上海一”支持。 不同区域云服务产品之间内网互不相通;请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。 平台用户权限限制 EIHealth平台
多输入1024个字符,SMILES不支持输入空格或者中文。 。 作业名称:设置作业名称。长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格,首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:100000个小分子记一次功能调用。 配置完成后,单击“提交”。
离子种类,支持选择NaCl、MgCl2、None,若设置了平衡电荷不支持选择None。 缺省值:NaCl ion_concentration 否 Float 离子浓度,单位mol/L,若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。 最小值:0 最大值:5.0 缺省值:0.15 表6
String 离子种类,支持选择NaCl、MgCl2、None,若设置了平衡电荷不支持选择None。 缺省值:NaCl ion_concentration Float 离子浓度,单位mol/L,若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。 最小值:0 最大值:5.0 缺省值:0.15 表7 ReceptorDrugFile
只有项目所有者和管理员能修改。 --tags -t 否 项目标签,多个标签使用分号(;)分隔。 只有项目所有者和管理员能修改。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。只有项目所有者能修改。 用数字0和1表示关闭和打开,以data-share、data-download、data-de
输出小分子表征:是否输出小分子表征文件,小分子表征文件可以用作训练模型使用,默认是不输出。 作业名称:设置作业名称。长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格,首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:20000个小分子记一次功能调用。 引用外部桶时,
下游分析:靶点口袋分子设计对应的下游分析为分子优化、合成路径规划和分子搜索,单击“确定”即可创建。 下载3D:如果分子设置了靶点,可以单击“下载3D”下载优化后的小分子或者复合物,如果分子未设置靶点,单击“下载3D”只能下载小分子。 每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数Score、Vina
作业名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。 标签:设置作业标签。 功能调用次数:合成路径规划目前是一个运行成功得作业消耗一次功能调用次数。 图1 分子合成路径 引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。
Cancelling、Cancelled、Unknown。 --workflow-name -t 否 流程名。 --user-name -u 否 用户名。 --job-name -j 否 任务名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,
发布等操作。 在“我的发布”中,只能下线发布账号发布的资产。管理员可以下线“组织共享”中发布的所有资产。 发布资产前,需要先设置商标。详细可参考商标设置。 父主题: 资产市场
关键概念 镜像 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平
ProbeDrugFile object 探针文件。 params PocketDetectionParamDto object 靶点口袋发现设置参数。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称,取值范围:[1
ProbeDrugFile object 探针文件。 params 否 PocketDetectionParamDto object 靶点口袋发现设置参数。 表4 CreateDrugJobBasicInfo 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 作业的名称,取值范围:[5
objects 配体列表。 graph FepGraphDto object 路径图。 params FepParamDto object FEP设置参数。 job_result JobResult object 作业结果信息。 part_failed_reason Array of FailedReasonRecord
- 101 graph 是 FepGraphDto object 路径图。 params 是 FepParamDto object FEP设置参数。 表4 CreateDrugJobBasicInfo 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 作业的名称,取值范围:[5
文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表7 BindSiteDto 参数 参数类型 描述 name String 靶点名称,只能设置为target1或者target2。 最小长度:1 最大长度:128 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件
文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表7 BindSiteDto 参数 参数类型 描述 name String 靶点名称,只能设置为target1或者target2。 最小长度:1 最大长度:128 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件