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切换到引用数据的路径,例如引用了gene-assent项目中的DataSet数据,使用health cd命令切换到该路径,并使用health ls名称查看详细数据。 当由引用数据的路径,切换到自己项目数据时,需指明具体的路径。 health cd gene-assent:/DataSet/ health
若当前所在目录为src2,新增子目录dataset。 health mkdir dataset # 创建成功不进行提示,可以使用health ls命令查看目录 父主题: 数据管理命令
设置完成后,单击“提交”,执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务,允许取消、强制停止或删除。 图6 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计出结合能的均值和标准差。单击热点图,可查看详细的3D分子对接结果、结合能排序、药物注释信息。 同时,基于预置的数据库模板,生成包含药物名称、结合能等信息的数据库。
平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述 resource_id 否 String 资源ID。 最小长度:1 最大长度:128 offset 否 Integer 偏移量,查询起始偏移,必须由数字组成,默认为0,取值范围[0
库,可以通过DETAIL查看所匹配的子结构特征。 Genotoxic Carcinogenicity Rule: 117个子结构,含有该子结构可能通过遗传毒性引起致癌性或者致突变性。 结果解释:数值代表有多少个子结构匹配此数据库,可以通过DETAIL查看所匹配的子结构特征。 NonGenotoxic
使用RNA-Seq流程的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅流程 步骤2:上传待分析数据 步骤3:创建分析作业 步骤4:查看执行结果 步骤1:订阅流程 使用RNA-Seq流程前,需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“RNA-Seq Analysis Based on STAR”流程。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅该流程。
用户可将归档数据恢复到项目桶,恢复到项目桶后,平台不会进行删除(恢复到项目桶中的数据会正常收取标准存储的费用)。 在归档管理页面,可以在“归档天数”列查看已归档天数(从归档复制完成时间开始算)。若用户早于90天删除归档数据,将收取费用,收取的费用=对应存储类别存储空间按需月单价*容量*剩余天数/30,超过90天不需要补。
使用NGS的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅流程 步骤2:上传待分析数据 步骤3:创建分析作业 步骤4:查看执行结果 步骤1:订阅流程 使用NGS流程前,需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“Variant Calling Based On NGS”流程。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅该流程。
对于“已取消”、“运行失败”的任务,单击图标,允许修改任务参数,再次提交任务。 图5 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计出结合能的均值和标准差。单击热点图,可查看详细的3D分子对接结果、结合能排序、药物注释信息。 在图6中,页面最右侧显示结合能的最大值和最小值,以及对应的列名称、行名称。
最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 favorite_id 是 String 收藏ID。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数
Summary的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅流程 步骤2:上传待分析数据 步骤3:创建分析作业 步骤4:查看执行结果 步骤1:订阅流程 使用Docking Summary流程前,需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“Docking Summary”流程。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅该流程。
在“删除标签”弹窗中,单击“确定”。 批量删除标签 您可以一次选中多个标签,单击页面左上角的删除按钮即可。 图2 批量删除标签 查找标签 在搜索框中输入标签名称关键字,单击按钮进行查找。 图3 查找标签 父主题: 系统设置
允许为空 主键所包含的列不允许设置为空。当数据库中某些数据允许没有值时,可设置为空。 是否可查询 依据模板中定义的列信息,给出数据库中可进行查询的数据,可查询至多设置10个。 描述 当参数设置为可查询时,可以添加描述信息。 是否唯一 对数据表中的一个或多个数据设置唯一约束,保证该数据与
可以在jupyter的文件系统中看到运行结果,也可以在基因平台项目的数据页面查看文件结果: 图4 jupyter中查看运行结果 图5 基因平台查看运行结果 在基因平台项目中查看自动投递的作业。 图6 查看自动投递的作业 父主题: genomeagent镜像
图3 删除标签 批量删除标签 您可以一次选中多个标签,单击页面左上角的删除按钮即可。 图4 批量删除标签 查找标签 在搜索框中输入标签名称关键字,单击按钮进行查找。 图5 查找标签 父主题: 系统设置
Container,简称SWR)进行简单易用、安全可靠的镜像管理。单击项目名称,进入所选项目,在“镜像”页签中,以列表形式展示了项目中的镜像。您可查看镜像的详细信息,执行镜像分类、添加描述、删除和查询操作。 图1 镜像管理 镜像用途 用于创建分析应用 应用是生物信息学软件的镜像封装。例如,您可将Cell Rang
searchable: true # 列是否可查询,必填 tips: uuid # 列的查询提示,非必填, 若该列为可查询列,可提供查询提示 - name: user_name description:
在平台右上角用户名中选择“系统设置”,设置邮件配置。 服务器地址:邮箱开通SMTP功能时的服务器地址,不同邮箱开通SMTP方式不同,请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址:填写邮箱地址,用于发送EIHealth平台的消息通知。 用户名:邮箱的用户名,如果未修改过,默认为邮箱地址。
ource-path为“/v3/auth/tokens”。 query-string 查询参数,可选,查询参数前面需要带一个“?”,形式为“参数名=参数取值”,例如“limit=10”,表示查询不超过10条数据。 例如,您需要获取IAM在“华北-北京四”区域的Token,则需使用
终端节点 终端节点(Endpoint)即调用API的请求地址,不同服务不同区域的终端节点不同,您可以从地区和终端节点中查询服务的终端节点。 医疗智能体平台的终端节点如表1所示,药物设计、临床研究的终端节点如表2所示,请您根据业务需要选择对应区域的终端节点。 表1 终端节点(医疗智能体平台API)