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除的核心项目,将进入“待删除项目”列表中。待删除项目会保留7天,6天内您可以将项目恢复成可用状态,最后一天不支持恢复。7天后,项目将自动删除,删除后不可恢复。非核心项目支持立即删除。 图5 项目状态 父主题: 项目管理
API设计规范,如表2所示。 表1 医疗智能体平台API 类型 API 说明 项目管理 项目管理 项目创建、获取项目详情、删除项目等相关操作API。 系统管理 系统管理 系统设置、系统资源、用户管理、消息中心、标签等相关操作API。 镜像管理 标签页面管理 导入镜像、更新镜像、创建镜像、删除镜像等相关操作API。
EditedLigand 参数 是否必选 参数类型 描述 source 否 String 文件来源,仅支持RAW。 最小长度:1 最大长度:6 format 否 String 文件格式,仅支持CIF。 最小长度:1 最大长度:6 data 是 String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。
status_list 否 Array 作业运行状态列表, 支持WAITING|RUNNING|FINISHED|FAILED|CANCELLED。 数组长度:0 - 10 type_list 否 Array 作业类型列表, 支持DOCKING|OPTIMIZATION|SYNTHES
子级。 您可以单击右上角“New”,然后选择AI引擎“Python 3”,创建一个用于编码的文件。 Jupyter Notebook页面不支持创建名称中带有特殊字符< > ' " ; \ ` = # $ %% ^ & ( )的文件或文件夹。 图2 选择AI引擎“Python 3”
member-name 无 是 用户名称。 --project -p 否 项目名称,不填时默认为当前所在项目。 --role -r 是 用户项目角色,只支持Administrator,Developer,Uploader或者Viewer。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth
member-name 无 是 用户名称。 --project -p 否 项目名称,不填时默认为当前所在项目。 --role -r 是 用户项目角色,只支持Administrator,Developer,Uploader或者Viewer。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth
类型:选择小分子化合物。 流程:选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。 配体分子:配体分子文件,支持SMILES、3D SDF、PDB、MOL2格式。 受体蛋白:受体蛋白文件,支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。
String 文件来源,支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度:1 最大长度:8 url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。
objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 20 ligands 是 Array of LigandDto objects 配体文件列表,当前仅支持1个。 数组长度:1 - 1 engine 否 String 引擎,默认为AUTODOCK_VINA。 缺省值:AUTODOCK_VINA
0,此时判定为子任务已正确执行。 实际上作业的子任务对应的就是K8S中的一个Pod,其返回状态就是Pod的phase映射,即容器以非0状态退出或者被系统终止会算做失败;容器return 0并且不再重启即算成功。详细内容介绍请参见Pod的生命周期。 处理建议 所有的算法程序的入口main函数
址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data 否 String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0
上传数据 NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。
-e 否 重命名。 --recursive -r 否 按指定的对象名前缀批量下载,批量下载时必选。 --force -f 否 强制操作,不进行询问提示,批量下载时可选。 --flat -l 否 批量下载时,不包含上一级父对象名前缀,批量下载时可选。 --update -u 否 增量下
资源包类型 支持标准存储单AZ包。 标准存储单AZ包适合数据分享、内容分享、热点对象应用场景。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围:1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。
时,应用名称不支持修改。 version: '1.0.0' # 应用版本 取值范围:[1,24],以小写字母或数字或大写字母开头,允许出现中划线,必须以小写字母或数字或大写字母结尾。更新应用时,应用版本不支持修改。 summary:
说明: 对于极其特殊的值,例如:qqq'\"`22,qqq'\"`22,aa`;`aaa:4444`,因为与上述要求的格式冲突,暂时不支持操作。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-
表10 EditedLigand 参数 参数类型 描述 source String 文件来源,仅支持RAW。 最小长度:1 最大长度:6 format String 文件格式,仅支持CIF。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。
只能以数字或字母开头。 最小长度:5 最大长度:64 labels 否 Array of strings 标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 表5 ReceptorDrugFile
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 labels 否 Array of strings 标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 响应参数 无 请求示例