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b支持更加灵活和更加强大的项目操作方式,但具有和Jupyter Notebooks一样的组件。 打开JupyterLab 选择状态为“运行中”的Notebook实例,单击“操作”列的“打开”访问Notebook。 单击右上角的“Open JupyterLab”,可直接打开此Not
导入的IAM子用户需要具有管理控制台访问方式。 导入用户时不能超出配额。如果超出配额,进行配额调整后,5分钟后生效。 以用户组的方式导入时,若超出配额的部分会导入失败。 以用户组的方式导入时,用户组里已经导入到平台的用户,不算统计个数。例如,用户组A里50个用户,10个已经导入平台, 那么统计时,只会显示已选择40个用户。
口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size 否 Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表8 CustomProp 参数 是否必选 参数类型 描述 id 是 String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1
取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤,进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig,根据contig下发对应的任务,并依据不同任务,指定并行下发的任务数,以降低流程整体的运行时间。 流程执行信息 NGS流程由fastp、bwa-mem、
引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果,输出结果缩略图。 图2 查看运行结果(1) 单击查看路径,查看输出结果详情。 可以单击左上角“下载”,下载当前的输出结果。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。
性能加速(可选) 当普通的计算资源不满足业务场景时,可以选择购买性能加速资源,加快算法的数据分析速度。 单击“购买性能加速”。选择包年包月或者按需,同时选择购买的性能盘大小。 图1 购买性能加速 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 在EIHealth平台,创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命
生成后的小分子在满足强约束条件的基础上,会根据满足弱约束条件的权重总和以及与参考小分子的相似度来打分并进行排序。在初始化权重的基础上,每个约束所占的权重,会在每一轮的分子生成迭代中,根据所满足的约束来进行动态调整。比如说约束条件1,在分子生成迭代中比较容易满足,那么该条件的权重会
于批量执行NGS的配置文件。本示例介绍使用方法一获取配置文件的方法。 方式一 使用EIHealth平台完成NGS流程的搭建,并执行成功,然后在“分析作业”页面导出作业信息.yaml文件。 方式二 使用命令行工具完成NGS流程的搭建,进而获取相应的配置文件。详细的操作请参见命令行工具。
Key):与访问密钥ID结合使用的密钥,对请求进行加密签名,可标识发送方,并防止请求被修改。 使用AK/SK认证时,您可以基于签名算法使用AK/SK对请求进行签名,也可以使用专门的签名SDK对请求进行签名。详细的签名方法和SDK使用方法请参见API签名指南。 签名SDK只提供签名功能,与服务提供的SDK不同,使用时请注意。
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码:
平台通过云审计服务(CTS)提供操作记录的收集、存储和查询,审计操作可以设置导出用户的写操作(默认)和读操作(可选),保存周期可以设置需要保存的审计日志的保存周期,下载按钮可以下载最近7天内最新的1万条数据审计日志,查看按钮可以查看及下载保存的审计日志。 通过审计日志可用于支撑安全
CPI预测 CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配,精确的预测化合物-蛋白相互作用。 单击“CPI预测”功能卡片,进入配置页面。 配置靶点文件。 支持3种输入方式,分别是输入氨基酸序列、选择文件、输入PDB ID 输入FASTA格式氨基酸序列,输入框最多支持
聚类分析”功能卡片,进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式:选择文件和手动输入类型。 上传分子文件:选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件;文件大小不超过5G;小分子支持10-10,000个,超出10,000的分子会进行截断。 输入小分子:可以通过上传文件或输入SMILES以输入小分子。
选择需要引用的项目以及项目中的数据,或者选择待引用的OBS桶路径,先选择OBS桶所在区域,再选择OBS桶名称,支持选择不在同一区域的OBS桶。 图3 引用数据 单击“确定”,引用其他项目中的数据至本项目。 引用的数据和项目将显示在左侧的数据列表中。 图4 引用的数据 引用OBS类型数据
operator {1}. 请检查查询条件中的操作符是否为该字段支持的操作符。 400 eihealth.01040028 Column {0} does not support query value {1}. 请检查查询条件中的值是否为该字段类型的值。 400 eihealth.01040029
分子ADMET属性值列表 similarity Number 分子与初始分子的相似度 num_fulfilled_weak_constraints Integer 分子所满足的弱约束数量 score Number 分子的打分 表8 MoleculeConstraint 参数 参数类型 描述
numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表11 CustomProp 参数 参数类型 描述 id String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述