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如何将Notebook中的数据下载至本地 在Notebook页面，可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。当在Notebook中上传文件提示大小受限时，您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
2。“图标”、“标签”、“短描述”、“描述”可选填。 图3 填写基本信息 选择镜像。 单击“选择镜像”，在“自定义镜像”列表中选择fastqc镜像和镜像版本。 依据FastQC命令说明填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量，并以大括号扩起，以$符号进行引用。
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错
项目是EIHealth平台的一个工作空间，可以在项目中存储数据，上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中，并通过设置成员角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。您可以创建项目
命令行工具概述 镜像、应用、流程、作业 1. 制作镜像 2. 创建应用 3. 搭建流程 4. 执行分析作业 常见问题 了解更多常见问题、案例和解决方案 热门案例 AK/SK是什么？如何获取AK/SK 如何搭建Docker环境？ 如何制作镜像？ 如何将生物信息学软件封装为镜像？ 更多 远程登录
基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能，通过获取示例数据，创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
算结果等。 容器镜像服务（SWR） 容器镜像服务（Software Repository for Container，简称SWR）是一种支持镜像全生命周期管理的服务，提供简单易用、安全可靠的镜像管理功能，帮助您快速部署容器化服务。 医疗智能体使用SWR存储工具镜像，包括内置工具及自定义工具的存储。
如果当前资源配额限制无法满足使用需要，您可以申请扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下： 统一身份认证（IAM） 容器镜像服务（SWR） 对象存储服务（OBS） 关于如何查看配额，如何申请扩大配额，请参见“《用户指南》 配额管理”章节。
使用Docking Summary流程 使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 使用AutoGenome镜像 genomeagent镜像 父主题： 用户指南（基因平台）
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像，并将镜像上传至EIHealth平台，通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用，也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”页面“工具”页签中，
项目管理 收藏管理 镜像管理 标签页面管理 项目审计管理 虚拟药物筛选 父主题： API（医疗智能体平台）
运行作业 方式1：使用预置的NGS流程 方式2：使用预置应用搭建NGS流程 方式3：自定义镜像运行FastQC流程
开发环境（Notebook） Notebook简介 创建Notebook Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题： 用户指南（基因平台）
√ √ - - - 查看、导出、下载 √ √ √ √ √ 应用管理 创建、更新、删除、导入、订阅 √ √ √ - - 发布 √ √ - - - 查看、导出、下载 √ √ √ √ √ 作业管理 启动、停止、取消、重试、更新、删除 √ √ √ - - 查看、导出、下载 √ √ √ √ √
台的镜像管理，实现高效的调用，极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境，里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。EIHealth平台使用容器镜像服务（Software
工具”页面的列表中，以“[资产市场]”进行标记。 订阅的镜像类资产，将显示在“项目管理 > 镜像”页面的列表中，以“[资产市场]”进行标记。 订阅的数据类资产，将显示在“项目管理 > 数据”页面。 收藏资产 资产市场提供了官方发布的镜像、数据、应用、流程资产，您可以进入资产页，单击右上
'/output' 获取镜像地址 对于已上传或平台上已有的镜像，您可以参考以下步骤拼接镜像地址。 登录医疗智能体平台，进入镜像所在的项目。 在页面上方单击“镜像”，进入镜像管理页面。 单击镜像名称，进入镜像详情页。在该页面查看“源项目”、“镜像名称”、“镜像版本”，按照以下规则拼接出应用配置模板中的image参数。
如何调用API 开通服务 构造请求 认证鉴权 返回结果
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