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弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
安装和使用MPI(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform
在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在集群上运行MPI应用。 IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
>1 以华为云管理控制台显示为准。 8 对象存储服务(OBS) 提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 9 镜像服务(IMS) 提供镜像(ROCE)的全生命周期管理能力,具有便捷、安全、灵活、统一的优势。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。
STAR-CCM+运行需要提供一个集群中所有节点均可读取的算例输入文件,通常做法是将算例文件放到NAS存储中,华为云SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储,并针对HPC有优化,建议直接使用华为云SFS Turbo存放算例文件。 HPC仿真软件STAR-CCM+需要每个节点都安装,比较麻烦
群。 图1 HPC-S²架构示意图 HPC-S²功能简介 HPC-S²主要面向对大规模计算有需求的企事业单位,使用HPC-S²控制台可以方便的对集群、节点、任务以及共享存储进行查看及管理操作,实现集群的一键式开通和部署等功能。 功能 说明 集群管理 HPC-S²的管理控制台提供了
Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens nfs vers=3,timeo=600,nolock 0 0"
操作场景 当集群不再使用后,可使用集群删除的功能将集群删除,如未勾选“删除云服务器”,节点资源将持续扣费,包周期资源需手动退订。 集群创建失败后,可使用集群删除的功能将集群删除,删除时不要勾选“删除云服务器”,然后再使用“已有节点部署集群”的功能重新部署集群。 集群出现异常后,如无法手
盘使用。 购买包年/包月裸金属服务器时购买的非共享数据盘,不支持单独续订、退订、开通自动续费、转按需付费方式、以及释放功能。 设置“自动备份”。 启用自动备份功能后,系统会根据您设置的备份策略,自动备份裸金属服务器。 勾选“使用自动备份”。 设置“备份策略”。 在下拉列表中选择备
启动集群 操作场景 停止状态的集群,如需再次开启集群执行作业,可将集群重新启动。 只有状态为“停止”的集群可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要启动的集群,单击后方操作列“更多 > 启动”。 单击“确定”。 在集群
操作场景 HPC解决方案服务的管理控制台提供了弹性文件服务SFS的自定义挂载和卸载的功能。集群创建完成后,您可以在共享存储页面为集群挂载/卸载弹性文件服务。通过弹性文件服务SFS为集群提供共享存储的功能。 当集群为运行状态时,您可以选择挂载/卸载弹性文件服务。当集群在创建中或部署状态时,不支持挂载/卸载共享文件服务。
关闭超线程 系统默认关闭,如果是打开的,需要进行关闭。 判断系统是否开启超线程。 通过查询系统的物理核数和逻辑核数的关系可以判断是否开启多线程,如果:逻辑核数 = 物理核数,说明没有开超线程;逻辑核数 = 2*物理核数,说明系统开启了多线程。 Linux系统可以通过查询/proc/cpui
方法二:使用已有节点部署HPC集群 操作场景 如果用户需要使用已有的ECS节点资源构建HPC集群,可以使用该功能进行集群的部署。下面介绍如何使用已有节点部署HPC集群。 使用已有节点部署集群,首先选择管理节点,再选择计算节点,切换计算节点与管理节点需要有相同的CPU架构,需要在相
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v2是一种Internet层协议,即可以实现路由功能。虽然RoCE协议这些好处都是基于融合以太网的特性,但是RoCE协议也可以使用在传统以太网网络或者非融合以太网络中。 应用场景 网络密集型