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项目名称,不填时默认为当前所在项目。 --role -r 是 用户项目角色,只支持Administrator,Developer,Uploader或者Viewer。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health
切换路径 使用cd命令在EIHealth项目中切换数据路径。 命令结构 health cd <path> 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 当前目录,不进行跳转。 health cd
命令中的archive可替换为backup 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --destdir -d 是 目标路径。 archive-id 无 是 归档id。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 恢复归档数据到根目录
要导入的镜像名称。 tag-name 无 是 要导入的镜像tag名称。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 从源项目lmx-project-02导入镜像到当前项目。 health docker import lmx-project-02/demo-image-1:1
名称,支持message或者completed-jobs。 --number -n 否 保存条数,范围:10000-10000000。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 修改消息的保留数目
"分割,如"a,b,c"。 --main_file -m 否 流程主文件名。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 命令示例 health nextflow edit workflow 5b5cd09c-bc14-11ed-b7f6-fa163e504fdd -w
最大值:60 max_prediction_per_product Integer 每个产物的最大反应数量。 最小值:2 最大值:20 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1"
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建分子搜索作业,作业名称为demo-job,分子SMILES表达式为string,从数据库中找到最相似top100的分子。 https
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建分子合成路径规划作业,作业名称为demo-job。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihea
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 作业ID。 limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建聚类分析作业,输入方式为分子文件,作业名称为demo-job。 https://{endpoint}/v1/{project_id}
名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 通过指定应用的ID或名称和版本删除应用。
--main_file -m 否 流程主文件名,默认为:main.nf。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 命令示例 health nextflow create workflow -n h2 -w "D:\testzip.zip" -d "h test"
指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --storage-type -s 否 归档的存储类型,支持STANDARD和COLD。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程。 health create backup h-test2 --path
重命名导入模板名称,不填时与源模板名称保持一致。 --current-project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health
增量下载操作,设置该参数后,下载每个文件时会比对本地的文件,仅在以下情况时下载数据: 文件不存在。 下待载文件大小与本地文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 下载数据前
缺省值:true 响应参数 无 请求示例 { "file" : { "source" : "EXTRANET", "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb" } } 响应示例 状态码: 200 预处理成功响应。
名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 通过指定流程的ID或名称和版本删除流程。
本地json/yaml格式参数文件路径。 --priority -o 否 作业优先级,支持输入的参数为0-9,默认值为0,0为最低优先级。 命令示例 health nextflow create job -n "j1" -w "113b2ee6-bcb3-11ed-b7f6-fa163e504fdd"
--description -d 否 流程的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 使用本地已填写好的流程模板workflow
是 镜像名称。 tag-name 无 是 镜像tag名称。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 health docker pull demo-project/demo-image:v1.0 # 执行成功返回结果如下 6be353e4af51: