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每个分段下载任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的down子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。
每个分段上传任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。
每个分段移动任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。
图3 导出作业元数据 Task失败状态条显示说明 每个Task 状态条显示成三段:Task添加重试失败总时间、当前pod等待时间、pod运行时间。 第一段表示所有重试失败的总时间,第二段表示当前pod等待时间,第三段表示当前pod运行时间。
--uploadIdMarker -u 否 列举桶内分段上传任务的起始位置,必须与--marker配合使用。返回结果是对象名和UploadId按照字典序排序后该参数之后的所有分段上传任务。
密码:邮箱开通SMTP功能时生成的一段随机字符。 消息头:发送邮件时,邮件标题。 语言:选择中文或英文。 删除邮箱后,将不再发送邮件通知。 图1 邮件配置 邮箱配置完成后,单击“测试”,验证配置是否有误。配置成功后将在邮箱中收到测试通知。
平衡阶段的模拟,用于自由能微扰计算。平衡模拟时长=时间步长×平衡步数/1000,单位为ns。时长增加,作业运行时间延长。 λ个数:默认值20,输入范围为2-30。自由能微扰的窗口数量。 名称:可修改,修改后左上角也同步修改。
最小值:1000000000000 最大值:9999999999999 key_word 否 String 关键字,支持在display_info字段中内容的模糊搜索。 最小长度:0 最大长度:128 sort_dir 否 String 排序规则,目前默认时间降序。
解决方法 根据实际业务需要,在“创建作业”阶段,设置合适的超时时间,默认设置的超时时间为24小时(1440分钟),最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 图1 作业设置 场景2 作业投递后处于运行中,但是无日志打印,也没有任何符合预期的输出文件生成。
依赖 Variant Sets GATK4在做Variant Calling阶段需要输入的参考Variants数据集。 输出 FastQC Report 原始测序数据的质控报告,以HTML文件形式展示。