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受体口袋检测 功能介绍 检测受体口袋,检测类型基于配体,基于氨基酸残基,自动检测,自定义和全局对接。
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
基因组变异检测 基于上述比对得到的bam文件,通过GATK4做Variant Calling,输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制,输出变异数目,变异类型统计等指标。
图8 NGS流程 父主题: 基于二代测序的基因组突变检测
父主题: 基于二代测序的基因组突变检测
数据归档配置 设置平台数据归档的区域。 在账号下面选择“系统设置”。 图1 选择系统设置 进入系统设置页面,设置数据归档配置区域。 图2 配置数据归档区域 父主题: 系统设置
health upload D:\local\data\xxx.R1.fastq.gz /input-data/ 父主题: 基于二代测序的基因组突变检测
图1 创建集群 基础配置:选择“计费模式”、“当前区域”。 集群类型选择“Elasticsearch”,输入集群名称。 图2 基础配置 节点规格:参考自己的数据库大小。自定义数据库所需要的的CSS节点规格大于“4 vCPUs | 8GB”,不支持“4 vCPUs | 8GB”。
区域名称 区域 终端节点(Endpoint) 协议类型 华南-广州 cn-south-1 eihealth.cn-south-1.myhuaweicloud.com HTTPS 父主题: 使用前必读
{ "result" : 0.9 } 状态码 状态码 描述 200 口袋检测成功响应。 错误码 请参见错误码。 父主题: 药物通用接口
HC.vcf.gz 参数1 参数名称:json-file 数据类型:File 必传:是 默认值:/gatk4-VariantQC.json 参数2 参数名称:html-file 数据类型:File 必传:是 默认值:/gatk4-VariantQC.html 父主题: 基于二代测序的基因组突变检测
图3 信息栏 图4 数据文件 图5 质控报告 父主题: 基于二代测序的基因组突变检测
开通AI辅助药物设计和临床研究API 进入EIHealth控制台,在页面左上角切换区域“华东-上海一”。 图1 切换区域 在API栏选择需要使用的服务,单击操作列的“开通服务”。 服务开通成功后,开通状态为“已开通”。 “开通服务”按钮置灰,说明您尚未认证,请先实名认证。
约束与限制 使用区域限制 医疗智能体目前支持的区域为“华北-北京四”、“华东-上海一”、华南-广州。 盘古辅助制药平台仅在“华东-上海一”支持。 不同区域云服务产品之间内网互不相通;请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。
父主题: 基于二代测序的基因组突变检测
病灶区域分割DICE(预测病灶和真实病灶的重合度)及AVD(预测病灶体积与真实病灶体积误差)指标业界领先,与医生用手工准确勾勒的结果高度一致。
图2 镜像列表 父主题: 基于二代测序的基因组突变检测
最新动态 本文介绍了医疗智能体EIHealth各特性版本的功能发布和对应的文档动态,新特性将在各个区域(Region)陆续发布,欢迎体验。
主要功能包括: 本地分子结构的3D可视化,支持多种显示样式,支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。 支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合,将不同结构叠合在一起,用于比较结构差异。