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环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 执行以下命令,重新生成可执行文件。 # cd # mpicc hello.c -o intel_hello 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 # mpirun
拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id root@192.168.0.166 配置ssh第一次登录免输入yes 在~/.ssh/config文件中加入如下内容: StrictHostKeyChecking
01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install glibc.i686 libgcc-4.8.5-11.el7.i686 增加执行权限,例如安装包所在路径为/root。
physical 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 5 SFS Turbo 提供按需扩展的高性能文件存储。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 6 虚拟私有云(VPC) 为云服务器等云上资源构建隔离、私密的虚拟网络环境。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘(EVS)
hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行Spetrum MPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
在单个BMS上通过MPICH运行可执行文件。 $ mpirun -np 2 -hostfile /home/rhel/hostfile /home/rhel/hello 图2 集群上运行MPICH成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。
hostfile /home/rhel/hello 图3 BMS集群上运行Intel MPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行社区OpenMPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
/home/rhel/hello 图3 BMS集群上Platform MPI运行成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
host-192-168-0-75 /root/spe_hello 图1 在集群上通过Spectrum MPI运行可执行文件 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用
-machinefile hostfile -np 12 /root/intel_hello hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 图3 集群上运行Intel MPI成功 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用
创建弹性云服务器 弹性云服务器C6h实例介绍 C6h实例为弹性云服务器下的一款裸金属产品,相比于普通的裸金属产品,C6h实例除了提供标准的以太网卡,还提供了一个支持RoCE协议的网卡,而RoCE协议相比于普通的以太协议最大的优势在于时延极低,特别适合HPC场景低时延业务。 购买弹性云服务器
执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将BMS对应的密钥文件(.pem文件)拷贝至.ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $ cd ~/.ssh $ mv *.pem id_rsa 执行以下命令,给密钥文件配置权限。 $ sudo chmod 600 id_rsa 执行
创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2,否则系统无法启动。 图1 创建系统盘镜像 图2 选择启动方式
# which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 执行以下命令,编辑文件。 # cd # vi hello.c 编辑内容如下: #include<mpi.h> #include<stdio.h> int
} $ mpicc hello.c -o hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的,都需要使用命令mpicc hello.c -o hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2
-F # service firewalld stop 执行以下命令,退出root权限。 # exit 执行以下命令,添加hostfile文件。 # vi hostfile 添加的内容为弹性云服务器的IP地址或者主机名(主机名需要在/etc/hosts中有对应IP地址信息),例如
MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello
3-1.0.1.0-rhel7.3-x86_64 # ./mlnxofedinstall 配置环境变量。 使用vim编辑“~/.bashrc”文件,添加如下配置内容: export PATH=$PATH:/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin export
0-rhel7.3-x86_64/ # ./mlnxofedinstall 配置环境变量。 执行以下命令,使用vim编辑“~/.bashrc”文件,添加如下配置内容。 export PATH=$PATH:/usr/mpi/gcc/openmpi-3.0.0rc6/bin export