检测到您已登录华为云国际站账号,为了您更好的体验,建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
配置命令行工具 步骤1:获取认证信息 步骤2:获取命令行工具 步骤3:初始化配置
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
获取并使用命令行工具eihealth-toolkit 步骤1:获取认证信息 步骤2:下载并安装命令行工具eihealth-toolkit 步骤3:初始化配置 步骤4:查看与执行操作命令
创建应用 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 应用”页签,单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据,如果需要批量执行NGS分析,可以选取以下任意一种方式进行批量执行: 方式一
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 PropDefinition object 属性定义的元信息 表5 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128
修改性能加速资源 查询消息及已完成作业保留设置 修改消息及已完成作业保留配置 获取供应商logo和名称设置 修改供应商logo和名称配置 获取系统配额信息 获取消息中心消息列表
图1 我的凭证入口 在“我的凭证”页面中选择“访问密钥”页签。单击“新增访问密钥”,按操作指引获取认证账账号的AK/SK,请妥善保管AK/SK信息。 图2 访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全,访问密钥仅在初次生成时自动下载,后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。
参数类型 描述 name String 自定义属性名称 最小长度:1 最大长度:32 description String 自定义属性描述信息 最小长度:0 最大长度:256 type String 属性预测类型 枚举值: binary numerical smiles Array
QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。 查看作业信息 点击作业的“作业信息”页面可以查看作业的运行时间和配置参数。 图14 查看作业信息 聚类分析 目前分子对接返回的结果小分子数较多,无法进行批量分析,通过一些聚类的 辅助方式能更好
当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 表1 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.03000001 invalid request data 根据错误详细信息检查请求体。 400 eihealth.03011001 Text type error
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 PropDefinition object 属性定义的元信息 表5 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128
藏CPI预测结果,收藏后可直接在收藏夹页查看。 图5 查看结果(2) 图6 查看结果(3) 查看作业信息页面。 从作业结果页面单击“作业信息”查看作业信息界面。 图7 查看作业信息 父主题: 苗头化合物发现
确定”,小分子支持SDF和PDB格式,复合物只支持PDB格式。 查看分子详情 查看作业信息 单击“作业信息”切换到作业信息页签,可以查看作业的分子信息、靶点信息与优化信息等。 图15 作业信息 聚类分析 目前分子优化返回的结果小分子数较多,无法进行批量分析,通过一些聚类的辅助方式
参数类型 描述 name 是 String 自定义属性名称 最小长度:1 最大长度:32 description 否 String 自定义属性描述信息 最小长度:0 最大长度:256 type 是 String 属性预测类型 枚举值: binary numerical smiles 是 Array
第1部分描述了蛋白质与配体小分子的结合能大小,以及该蛋白质在所有配体小分子的对接结果的均值和标准差。 第2部分描述了配体小分子信息,注释结果如下。 分类:该小分子的在DrugBank中分类信息。 化学式:小分子的化学式。 XLOGP3:小分子的脂溶性logP。 TPSA:小分子的拓扑极性表面积。 靶点:小分子的靶点。
docker images [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 查询指定镜像名下的所有tag信息,支持模糊查找。 --type -t 否 查询某个类型的镜像,可选APP、NOTEBOOK、OTHER。 --project 无 否 指定
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition PropDefinition object 属性定义的元信息 表8 PropDefinition 参数 参数类型 描述 id String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128 name String
"region_id": "aaa", //假设区域名称是“aaa” ...... 当接口调用出错时,会返回错误码及错误信息说明,错误响应的Body体格式如下所示 { "error_msg": "The format of message is error"
String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 表9 object 属性定义的元信息 表9 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 PropDefinition object 属性定义的元信息 表9 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128