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String 实例执行状态 pod_ip String 实例IP host_ip String 实例所在节点IP host_name String 计算节点的名称 start_time String 实例创建时间 container_statuses Array of TaskInstan
score分数。 similarity 靶点口袋分子设计后的分子与原始分子的相似度,计算的是ECFP4 Tanimoto相似度。 score 优化后小分子的综合打分。 Vina Score1 分子优化如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina Score进行排序,Vina Score Top1分数。
HTTP请求方法 方法 说明 GET 请求服务器返回指定资源. PUT 请求服务器更新指定资源。 POST 请求服务器新增资源或执行特殊操作。 DELETE 请求服务器删除指定资源,如删除对象等。 HEAD 请求服务器资源头部。 PATCH 请求服务器更新资源的部分内容。当资源不存在的时
app_resource TaskResourceDto object 应用资源 app_node_labels Array of strings 计算节点标签 表9 TaskResourceDto 参数 参数类型 描述 cpu String cpu申请使用量,取值范围[0.1-128],
上传大于1GB数据 当数据过大,或者数据处于服务器上时,页面传输并不是很方便,所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令,将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
app_resource TaskResourceDto object 应用资源 app_node_labels Array of strings 计算节点标签 表10 TaskResourceDto 参数 参数类型 描述 cpu String cpu申请使用量,取值范围[0.1-128]
local_disk,则开启本地盘加速。 node_labels: # 计算节点标签 标签个数取值范围[0-1],单个节点标签最大长度56个字符,以字母或数字开头,可以包含下划线(_)、中划线(-)、点(.)、字母和数字,且必须以字母或数字结尾
制作业。 查看执行状态 您可以通过单击作业名称,进入详情页面,查看详细的运行信息。包括运行状态、标签、描述、创建时间、完成时间、运行时间、计算节点标签、加速类型、优先级等。单击“概述”列按钮,在展开的信息栏中查看作业的输入&输出、节点参数、应用;在作业的子任务中可以查看日志、事件
- 'echo eihealth;' node_labels: # 计算节点标签 标签个数取值范围[0-1],单个节点标签最大长度56个字符,以字母或数字开头,可以包含下划线(_)、中划线(-)、点(.)、字母和数字,且必须以字母或数字结尾
足 io_acc_info IoAccInfoDto object 作业的描述 node_labels Array of strings 计算节点标签 still_running_tasks Array of strings 仍在运行中的子任务 表4 ToolInfoDto 参数
- 'echo eihealth;' node_labels: # 计算节点标签 标签个数取值范围[0-1],单个节点标签最大长度56个字符,以字母或数字开头,可以包含下划线(_)、中划线(-)、点(.)、字母和数字,且必须以字母或数字结尾
LigandDto 参数 是否必选 参数类型 描述 ligand 是 DrugFile object 配体文件。 count 是 Integer 计算个数。 最小值:1 最大值:1000000 表10 DrugFile 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体
MD模拟的温度,单位K。 最小值:0 最大值:1000.0 缺省值:300 step_params MdStepParam object 计算步骤参数 表11 MdStepParam 参数 参数类型 描述 energy_minimization_steps Integer 能量最小化的步骤。
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 server String 服务器地址 subject_prefix String 展示名 user_name String 用户名 email String 邮箱 language
oken。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 server 是 String 服务器地址 最小长度:1 最大长度:128 subject_prefix 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 user_name
MD模拟的温度,单位K。 最小值:0 最大值:1000.0 缺省值:300 step_params 否 MdStepParam object 计算步骤参数。 表10 MdStepParam 参数 是否必选 参数类型 描述 energy_minimization_steps 否 Integer
最大长度:10000000 表10 LigandDto 参数 参数类型 描述 ligand DrugFile object 配体文件。 count Integer 计算个数。 最小值:1 最大值:1000000 表11 DrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部
Score、Similarity(侧链修饰/骨架跃迁场景)、QED。 Score:代表小分子可合成性的综合打分。 Vina Score:代表分子如果添加了靶点,将会计算对接结合能。 Similarity:靶点口袋分子设计后的分子与原始分子的相似度。 QED:代表分子的成药性。 图4 查看运行结果(1) 图5
ina Score(有靶点)、Score、Similarity、QED、SaScore Vina Score:代表分子如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina Score进行排序 Score:代表优化后小分子的综合打分。 Similarity:代表优化后的分子与原始分子的相似度。
&& ./configure --prefix=/usr/local/samtools && make && make install 按Esc键,并执行:wq保存并退出Dockerfile。 制作镜像。 docker build -t bwa_samtools:0.7.17-1.10