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作业依赖的组件类型,仅支持填写workflow tasks 否 Array of JobTaskDto objects 基于替换规则压扁后,job实际的运行信息 数组长度:0 - 64 io_acc_id 否 String 作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用 最小长度:0 最大长度:128
据等操作均为系统的异步任务,您可以在“消息中心”中查看任务的执行状态。同时,平台针对该类任务支持您在“作业 > 数据作业”中查看任务的执行信息。在数据作业页面,支持通过作业类型、创建者、状态、创建时间、完成时间来进行搜索。 数据作业支持取消、删除、重试操作,三种操作均支持批量操作。
程不存在等等 user_name String 自动作业的创建者 tool_info ToolInfoDto object 作业依赖的组件信息 database_id String 自动作业依赖的数据表ID database_name String 自动作业依赖的数据表名称 表6
预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。 表6 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long
结尾不能有/。 tasks: # 流程中子任务的描述信息,子任务数量取值范围:[1,128] - task_name: app1-1 #
inputs: - name: input-dir # 子任务的输入参数信息 values: # 子任务的参数数值,根据参数类型进行合法性校验
失败原因,当作业执行失败时会返回 user_name String 创建任务的用户名称 tool_info ToolInfoDto object 作业依赖的组件信息 io_acc_id String 作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用; io_acc_expected_usage Integer
自动作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用 最小长度:0 最大长度:128 tasks 否 Array of JobTaskDto objects 自动作业依赖的流程信息 数组长度:0 - 64 表4 DatabaseTriggerDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 触发器的列名,取值范围:[1
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 receptors 是 Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 20
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 作业基本信息。 receptor 是 ReceptorDrugFile object 受体文件。 ligand 是 ProbeDrugFile object
oject时,默认为当前项目。 --yaml和--workflow命令不能同时存在。 --description -d 否 作业的详细描述信息。 --input -i 否 输入参数名称,该参数与流程中的输入参数对应,通过修改--input,修改输入数据。 选择时,input和input-file二选一。
请求消息头 附加请求头字段,如指定的URI和HTTP方法所要求的字段。例如定义消息体类型的请求头“Content-Type”,请求鉴权信息等。 如下公共消息头需要添加到请求中。 表3 公共请求消息头 参数名 说明 是否必选 示例 Content-type 消息体的类型(格式)
-variantqc应用构成。在创建应用前,请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 作业基本信息。 receptor 是 PocketMolDesignReceptorDto object 靶点文件。 ligands 否 Array of
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 receptor 是 TargetOptReceptor object 受体文件。 ligand 否 TargetOptLigand object
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 receptor 是 ReceptorDrugFile object 受体文件。 ligands 是 Array of LigandPreviewDto
表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 job id,不指定job-id时,列出当前project的全部job的基本信息。 --type -t 否 查询类型,默认detail。此参数用于获取作业列表。 取值:logs、detail、reports 。 logs:获取job日志。
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 作业基本信息。 smiles_list 否 Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10 - 10000
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 smiles 否 String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 molecule_file 否 DrugFile
在配置文件中通过recordMaxLogSize和recordBackups分别配置。 当涉及多文件/文件夹时,如需确认失败任务的具体错误信息,可参考结果清单文件夹下的失败结果清单文件“cp_failed_report_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e