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/1000,单位为ns。时长增加,作业运行时间延长。 λ个数:默认值20,输入范围为2-30。自由能微扰的窗口数量。 名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。
计算资源管理 购买计算资源 查询计算资源 删除计算资源 获取节点剩余配额 查询计算资源规格 关闭计算资源 重启计算资源 启动计算资源 修改计算资源调度信息 查询计算资源调度信息 查询bms计算资源显卡id列表 获取EVS配额及使用情况 父主题: 系统管理
对于状态为“失败”或者“已取消”的作业,可以选择重试。单击对应作业操作列“更多>重试”,根据提示对话框,选择“立即重试”或者“更改参数”。 如果选择“更改参数”,系统会跳转至作业参数配置页面,进行修改后,单击“重试作业”。 搜索 普通搜索 在作业管理页面,右上角搜索框中输入作业名称,单击按钮进行搜索。 图3
功能模块。 克隆作业 克隆已有的作业,作业的参数及流程一并克隆到新作业中。 在“作业中心”页面,单击作业操作列的“克隆”。 在作业详情页面修改对应的参数信息。 参数确认无误后,单击“提交”按钮。 父主题: 作业管理
-s命令获取启动分析作业的模板。依据模板要求,将步骤3中获取到的NGS作业信息和workflow-id填充至模板中,修改好的配置文件示例请参见NGS配置文件示例。 请将该模板保存为.yaml格式至本地,并在本地完成模板修改。例如,命名为ngs.yaml。 编写执行脚本并提交作业 运行分析作业时,流程中的每一个
&& ./configure --prefix=/usr/local/samtools && make && make install 按Esc键,并执行:wq保存并退出Dockerfile。 制作镜像。 docker build -t bwa_samtools:0.7.17-1.10
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”,其他参数可选填。参数填写完成后,单击“确定”,完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用,并使用鼠标拖拽至画布中。
在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号以及系统管理员权限的更改。在用户操作列,单击“编辑”,重置用户的相关信息。 最终租户可以编辑子用户角色、手机号、邮箱。 系统管理员只能编辑角色,非系统管理员无编辑权限。
节点伸缩策略 也可以通过单击某个策略操作列的“编辑”或者“删除”,对已有的策略进行修改或者删除操作。如果删除,则会同步删除节点。如果编辑,不支持修改可用区、节点规格、系统盘和数据盘,其他参数均可修改。 单击某个策略操作列的“事件”,查看该策略的事件信息。事件保存时间为30天,30天后自动清除数据,查询时间最多15天。
选择属性模型:选择AI模型。如果需要创建模型,可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。 名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。
使用URL方式将公网http/https/ftp链接的数据或者OBS中的数据导入。 单击数据中心右上角“URL导入”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用URL导入 父主题: 数据管理
发布流程的名称。名称长度为1-56,只允许出现中划线、下划线、字母和数字。 展示名称 发布成功后在组织共享中展示的名称。若不填写,展示的名称和流程名称相同。发布成功的流程不支持修改展示名称。 版本 发布流程的版本。 版本长度必须为1-24个字符,以字母或数字开头(多个字符可以连续),中间只能包含-.特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。
字母和数字,且必须以字母或数字结尾。 展示名称 发布成功后在组织共享中展示的名称。若不填写,展示的名称和应用名称相同。发布成功的应用不支持修改展示名称。 版本 发布应用的版本。 版本长度必须为1-24个字符,以字母或数字开头(多个字符可以连续),中间只能包含-.特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。
使用URL方式将公网http/https/ftp链接的数据或者OBS中的数据导入。 单击“添加数据”,类型选择“URL”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用url导入数据 父主题: 数据管理
母,数字,中划线和下划线。 展示名称 发布成功后在组织共享中展示的名称。若不填写,展示的名称跟发布数据的名称保持一致。发布成功的数据不支持修改展示名称。 版本 发布数据的版本。 版本长度必须为1-64个字符,只支持字母,数字,中划线,下划线和点号。 类型 数据。 标签 设置发布数据的标签。
选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果没有受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。 全局对接 将整个受体作为口袋位置。 自定义 手动修改口袋位置和大小。 padding 口袋位置放大多少尺寸。 对接引擎类型:DSDP、AutoDock Vina。 单击“下一步”,进入优化设置页面。
和数字,且必须以小写字母或数字结尾。 展示名称 发布成功后在组织共享中展示的名称。若不填写,展示的名称和镜像名称相同。发布成功的镜像不支持修改展示名称。 版本 发布镜像的版本。 版本长度必须为1-64个字符,只支持字母,数字,中划线,下划线和点号。 类型 镜像。 标签 设置发布镜像的标签。
单击“重置手机号”后,可以选择清除手机号或绑定新手机号。 单击“重置密码”后,输入新密码和确认密码。用户密码重置成功后,首次登录成功需要再次修改密码。 父主题: 用户管理
是否删除原数据。如果选择删除原数据,系统会在归档完成后统一删除已归档数据。归档后的数据可在归档中心查看或恢复。 在归档过程中请不要对归档的文件或者文件夹进行添加、更改操作,以免造成您的数据损失。 选择归档数据 选择该项目下需要归档的数据。 单击“确认”,进行归档。 归档操作将记录在“归档”页面,您可以在
图3 项目概览 查看项目详细信息 单击项目名称,进入项目“设置”页面。您可以在该页面,查看项目的数据存储量、作业总量、流程数量和应用数量,修改项目是否核心项目。 同时,可以查看项目的基本信息、数据控制信息和成员信息。 图4 项目详细信息 项目状态 可用:项目当前状态正常。项目创建