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创建应用 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 应用”页签,单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据,如果需要批量执行NGS分析,可以选取以下任意一种方式进行批量执行: 方式一
如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录,请使用cd命令切换路径。例如,切换至D盘: cd /d d: 图2 客户端 使用Linux版本命令行工具时,您需要在本地搭建Linux环境,并将下载的health文件放置所需的目录下,例如: 如果当前目录为health所在目录,可以使用./health命令执行命令行工具。
最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 type 否 String 下载类型(仅支持PRIVATE|PUBLIC) 枚举值: PRIVATE PUBLIC EXTRANET url 否 String 资源地址(支持https、obs地址) 最小长度:1
使用AutoGenome镜像 AutoGenome是Notebook镜像,利用AutoML等技术帮助科研工作者在基因组学数据上端到端实现深度学习网络搜索,训练,评估,预测和解释的工具包。 使用AutoGenome镜像的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅镜像 步骤2:创建Notebook 步骤3:预览AutoGenome案例
8GB”,不支持“4 vCPUs | 8GB”。 节点存储:建议选择“超高I/O”。 单击下一步“网络配置”。 图3 节点 网络配置:输入管理员密码,公网访问选择“自动绑定”,单击“下一步高级配置”。 图4 网络配置 单击“下一步:高级配置”,在弹窗里单击“确认”。 图5 确认 高级配置。 图6
进入医疗智能体“总览”页面,单击“EIHealth”。 图3 购买EIHealth平台 根据实际需求选择计费方式。 图4 选择计费方式 区域:请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。不同区域云服务产品之间内网互不相通。 平台规格:选择“基因平台”或“药物平台”。 平台计费方式:选择“包年包月”或“按需”计费。
进入医疗智能体“总览”页面,单击“购买平台”。 图3 购买平台 购买盘古辅助制药平台。 图4 购买盘古辅助制药 区域:请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。不同区域云服务产品之间内网互不相通。 平台规格:选择“盘古辅助制药平台”基础版或者专业版。 平台计费方式:选择“包年包月”或“按需”计费。
上海一”、华南-广州。 盘古辅助制药平台仅在“华东-上海一”支持。 不同区域云服务产品之间内网互不相通;请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。 平台用户权限限制 EIHealth平台支持两种类型的用户管理,可以帮助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 EIHealth平台用户管理类型
态的计算节点,将无法在此节点运行作业。 通过“新建流程”时创建 在“工具”页面,单击“新建流程”,填写流程信息。请参考新建流程操作。 流程搭建完成后,单击“新建作业”。 图1 新建作业 在新建作业弹窗中单击“确定”。 图2 新建作业 在弹出的作业设置页面,填写作业信息。“作业名称
--versionId -V 否 复制单个对象时可指定的源对象版本号。 --acl -a 否 复制对象时可指定的目标对象的预定义访问策略。 支持的值: private:私有读写 public-read:公共读 public-read-write:公共读写 bucket-owner-full-control:桶拥有者完全控制
持versionId选项。 移动对象时该参数可选。 --acl -a 否 移动对象时可指定的目标对象的预定义访问策略。支持的值: private:私有读写 public-read:公共读 public-read-write:公共读写 bucket-owner-full-control:桶拥有者完全控制
径样式为:path/;引用数据时目的存放路径为本项目的根目录,故无需指定destdir。 --md5s -m 否 网络下载链接对应的md5列表,值用; 分隔,和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
带容量单位配置,例如,配置1MB代表1048576字节。 --acl -a 否 同时上传文件时可指定的预定义访问策略。支持的值: private:私有读写 public-read:公共读 public-read-write:公共读写 bucket-owner-full-control:桶拥有者完全控制
关键概念 盘古药物分子大模型 盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分
基本概念 盘古药物分子大模型 盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分
下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
在该目录中创建一个空白文件abc.txt,创建一个webapp目录。 touch abc.txt mkdir webapp 在该目录中下载一个网络图片。 wget https://www.baidu.com/img/bd_logo1.png 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。
ARCHIVE_DATA_DELETE 删除归档数据。删除归档数据时给予消息提示,删除结果给予消息提示。 IMPORT_NETWORK_DATA 导入网络数据。导入网络数据时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 SUBSCRIBE_DATA 订阅数据。订阅数据时给予消息提示,订阅结果给予消息提示。
使用命令行工具下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
该命令不支持将数据上传到引用目录。 最小可以上传0Byte的空文件或文件夹,最大可以上传48.8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。