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是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id task_id 是 String 分子优化任务ID 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 响应参数 状态码:
not create hard link相关错误信息。 场景1 作业投递后处于运行中,运行过程正常,但是最后超时失败。 排查思路 判断是否是作业超时。 单击“状态”右侧的失败图标,查看失败原因,若为Graph timeOut for executin xxx,则可以确认为作业超时失败。
eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 workflow_id 是 String
<app-id:source_project_name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 source_project_name 无 是 要导入的应用当前所在的源项目名称。 app-id 无 否 源应用ID。 app-name 无 否 源应用名称。 version 无 否 源应用版本。
此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件进行分子优化。靶点1对应的约束条件是target1_binding_energy,靶点2对应的约束条件是target2_binding_energy 您可以通过“上传靶点”,将受体文件上传。受体文件仅支持pdb
工具管理简介 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像,并将镜像上传至EIHealth平台,通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”
edit和update作用相同 health update workflow ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 可选: 流程的ID(workflow-id),使用命令行工具创建流程时生成。示例请参见创建流程命令示例。 流程的名称、版本、所在项目名称(
错误码(AI辅助药物设计) 当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 表1 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.03000001 invalid request data 根据错误详细信息检查请求体。 400
eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 流程ID,指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时,获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径,以yaml格式保存。如果没指定,则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health
标签:选择流程标签,最多可添加5个。 描述:设置流程相关描述。 单击“下一步”,添加流程文件。 单击“流程文件”后面的“添加”,添加流程文件。 如果流程文件上传的是zip包,则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf,为压缩文件夹中的文件完整路径。例如:main.nf。若不填写,默认为main.nf。
购买资源 盘古辅助制药平台购买完成后,单击“进入平台”,在平台右上角单击用户名,选择“资源中心”。 您可以根据实际需求选择购买功能调用套餐包和存储套餐包。在后续使用过程中,也可根据使用情况随时购买资源。 资源中心 在“资源中心>功能调用”中可以查看功能调用套餐包的使用情况。 图1
edit和update作用相同 health update app ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 可选: 应用的ID(app-id),使用命令行工具创建应用时生成。示例请参见创建应用命令示例。 应用的名称、版本、所在项目名称(app-n
制作并上传镜像 NGS流程由fastp、bwa-mem、picard-insertsize、qualimap-bamqc、gatk-markduplicates、gatk-bqsr、gatk-applybqsr、gatk-haplotypecaller、gatk-mergevcf
单位为GB。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型,以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如,GATK是基于X86指令集开发的生信软件,使用CentOS的X86系统创建GATK镜像,则在创建应用时选择“X86”。 CPU需求:请按实际需求填写,取值范围为“0
上传镜像到SWR镜像仓库 上传镜像前,您需要安装容器引擎并完成镜像的制作,详细操作请参考安装容器引擎、制作Docker镜像。如果您已经安装了容器引擎,请跳过该步骤。 下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构
}::{src_project_name}格式,用于手动创建场景 # src_project_name在使用导入or订阅的资源是需要填写,为空表示本项目 # 2. 其他场景,app_id为系统分配的唯一标识 app_id: xxx
片、列表以及3D的形式查看。默认展示卡片页面,用户可自行进行切换。 图11 查看聚类详情 每个结果页面只用进行一次聚类分析操作。 聚类结果是存成文件,如果文件被删或者获取不到的话会有警告, 聚类结果不存在。此时可以单击“重新聚类分析”。 如果聚类失败,根据提示失败原因解决问题后,可单击“重新聚类分析”