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MOL 3D Viewer Mol 3D Viewer工具支持查看蛋白质和小分子的3D结构。单击“功能模块 > 通用工具 > MOL 3D Viewer”，进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括： 本地分子结构的3D可视化，支持多种显示样式，支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染
靶点口袋分子设计 基于盘古药物分子大模型，靶点口袋分子设计功能主要是能够根据给定的口袋和小分子利用AI的预测出更优小分子。 单击“靶点口袋分子设计”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面上选择设计方式 设计方式：支持侧链修饰、骨架跃迁、片段生长和从头生成四种方式。 侧链修饰：会在不同的侧链上进行侧链生长
自由能微扰 自由能微扰基于纯国产分子动力学模拟库SPONGE，产生自动化FEP工作流，端到端计算配体修饰造成的亲和能改变。 单击“自由能微扰”功能卡片，进入上传文件页面。 在上传页面右侧，选择上传受体，上传配体，选择中心配体。 上传受体：受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体：配体仅支持
认证鉴权 调用接口有如下两种认证方式，您可以选择其中一种进行认证鉴权。 Token认证：通过Token认证通用请求。 AK/SK认证：通过AK（Access Key ID）/SK（Secret Access Key)加密调用请求。 Token认证 Token的有效期为24小时，需要使用同一个
合成路径规划 合成路径规划基于盘古药物分子大模型，根据给定的目标分子，可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件：支持SDF
简介 Nextflow是专门针对生物信息流程搭建而开发的一种框架语言，它能够很好的管理生信流程，并且将其与Conda、Docker、Singularity结合起来使用，可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移，并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的程序模型
什么是医疗智能体 医疗智能体（EIHealth）平台是基于华为云AI和大数据技术优势，为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源，是一站式的医疗研发平台。
发布流程 您可以将创建的流程发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“流程”。 选择需要发布的流程，单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面，填写发布流程的相关信息。 表1 发布流程参数说明 参数 说明 名称
发布应用 您可以将创建的应用发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“应用”。 选择需要发布的应用，单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面，填写发布应用的相关信息。 表1 发布应用参数说明 参数 说明 名称
获取镜像 获取创建分析应用的镜像 创建分析应用时，您可以通过Docker Hub等镜像仓库，搜索引擎，自己制作等途径获取所需的镜像。 例如，可在Docker Hub获取bwa软件（用于将基因序列比对到参考基因组上）。 以下类型镜像，建议您通过Docker Hub获取，不建议自己制作
URI GET /v1/{project_id}/nextflow/engines/{id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。
上传小于1GB数据 上传数据 上传数据是最常用的添加数据功能，但由于网页传输大文件时存在一定的限制，所以上传数据的大小不能超过1GB。 图1 上传数据 复制数据 复制数据会从别的项目中复制一份数据到当前项目中，这里可选择的源项目需是当前账号为管理员的对应项目。如需设置项目成员，请参考用户指南中的项目成员和权限
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook
作业执行失败排查思路 启动作业后作业一直处于已提交的状态 问题现象 作业投递后一直处于已提交的状态。 问题排查和解决方案 查看execution log， 若execution log为空，请提交工单或联系服务技术支持。 execution log 提示K8S pod can‘t
数据管理简介 EIHealth平台使用对象存储服务（OBS）存储原始数据、流程执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分，从项目角度进行数据的管理，不同项目的数据可以通过“导入数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面，“数据”页签中，完成数据的添加、导入、归档、
图1 删除平台（按需计费） 图2 释放平台（包年包月计费） 话单延迟导致欠费 当前华为云账单都会有一定的延迟计费，延迟时间在1小时左右，故需要提前预留1小时以上的费用来删除平台，以防欠费。 若您是利用优惠券购买平台，则需注意，欠费则不能用优惠券补充。
为了全面、系统地评估药物对新冠病毒所有靶点蛋白的结合情况，华为云EI医疗智能体团队与华中科技大学同济医学院基础医学院、华中科技大学同济医学院附属武汉儿童医院、西安交通大学第一附属医院、中科院北京基因组研究所迅速成立联合团队，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模
eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/subscribe 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 资产订阅目标项目 最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目
方式3：自定义镜像运行FastQC流程 应用是运行作业的最小单位，每个应用依托于一个镜像进行创建。 方式2使用直接制作好的应用。用户也可以自己制作镜像，并基于镜像创建应用。 本示例中制作FastQC镜像，并基于镜像创建应用，运行分析作业。 镜像简介 由于生物信息学软件，往往由于不同的操作系统
查询数据库资源 功能介绍 查询数据库资源 URI GET /v1/{project_id}/system/database-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。
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