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步骤2：制作镜像 步骤3：上传镜像 步骤4：创建应用 步骤1：搭建Docker环境 搭建Docker环境，您可以任选以下两种方式搭建Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通
二代测序fastq的Read1文件。 fastq-file2 file 二代测序fastq的Read2文件。 输出参数 fq-file1 file Read1过滤之后输出fq.gz文件。 fq-file2 file Read2过滤之后输出fq.gz文件 json-file file 以JSON文件的格式输出的质控报告。
段优化，存在多个原始配体时可通过下拉框选择，与上传配体文件二选一。 上传配体文件：通过上传与靶点结构有良好结合构象的配体文件确定配体，若文件中包含多个配体，默认只处理第一个，与选择原始配体二选一。仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件，且只支持3D结构。 标记位点：3D可视化区域
gpu_type: '' gpu: '0' io_acc_type: SFS 上传并运行作业。 单击“上传作业”，在弹出的页面中上传yaml模板，上传成功后，即可运行作业。 父主题： 作业管理
模型数据文件来源。 枚举值： public private url 是 String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 eihealth_project_id 否 String 模型文件所在项目id，仅文件为数据中心时填写。
是否必选 参数类型 描述 file 否 File 文件流对象 part_number 否 Integer 分段序号，表示第几个文件片段 最小值：1 最大值：128 缺省值：1 total_part 否 Integer 分段总数，上传的文件总共分成了几个片段 最小值：1 最大值：128
> 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”，获取输出结果的路径。 文件的命名方式为：蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2 下载小分子构想数据 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
平台也提供了yaml格式的数据库模板，您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用，数据库模板支持yaml或yml格式，且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”，单击“下载示例文件”下载数据库模板示例，编辑后上传模板文件至平台，单击“确定”。 图2 上传模板 模板示例如下： database:
可自定义。 详细镜像制作过程请参见制作Docker镜像和Dockerfile参考。 上传镜像。 上传镜像。 在“项目管理”页面“镜像”页签中，可查看已上传的镜像。 在平台镜像管理列表中，将已上传的镜像分类为“NOTEBOOK”。 步骤4：创建并使用Notebook 在医疗智能体平台选择“项目管理
在“作业”列表中，可单击作业名称查看作业信息和输入输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径，可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览，zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题： 运行作业
构建数据库。 数据文件：输入数据库文件，仅支持CSV格式，文件不大于1G，数据条数支持最多5,000,000条，超过5,000,000条将进行截取。文件必须有两列是“SMILES”、“NAME”，不区分大小写。文件不允许有中文，数据库小分子会自动去重。 数据文件列名：选择数据库列
数据管理 创建文件夹 查询数据列表 获取桶存量信息 复制项目数据 导入项目数据 导入网上数据 引用项目数据 订阅资产市场数据 上传数据文件 批量删除项目数据 获取桶列表 查询项目级数据权限控制策略 设置项目级权限控制策略 获取数据详情 设置数据对象策略 发布数据资产 父主题： 数据管理
--simple -s 否 以精简格式显示查询结果，返回结果只包含对象名。 --recursive -r 否 递归列举本项目文件夹中的所有文件和子文件夹。 --v -v 否 列举桶内多版本对象，列举结果包含最新版本的对象和历史版本的对象。 --marker -M 否 列举桶内对
workflow命令引用本地的配置文件，创建流程。 命令结构 health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description
使用create app命令引用本地的配置文件，创建应用。 命令结构 health create app [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。 --description -d
a/目录进行归档，a/目录下最深一级的文件 a/xxxx/xxx./.../obj的总长度不能超过987。 执行归档操作时，若包含禁止删除的文件或文件夹，并打开了删除原数据开关，则被设置为禁止删除的文件或文件夹会删除失败，其他文件或文件夹删除正常。 使用obsutil上传数据，必须加full controle，否则会导致归档失败。
mplate详情。 --sample -s 否 显示示例yaml文件内容，以yaml格式打印到控制台，需要直接获取示例文件可使用Linux输出流重定向。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealt
存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标，设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据，可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 包含本项目桶最多挂载6个，不包含本项目桶最多挂载5个。 用户在Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作。
PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。
PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式，仅支持FASTA，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1
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