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购买资源 盘古辅助制药平台购买完成后,单击“进入平台”,在平台右上角单击用户名,选择“资源中心”。 您可以根据实际需求选择购买功能调用套餐包和存储套餐包。在后续使用过程中,也可根据使用情况随时购买资源。 资源中心 在“资源中心>功能调用”中可以查看功能调用套餐包的使用情况。
查看执行结果 作业运行完成后,可以在“作业中心”页面,单击作业名称,查看输出结果和作业信息。 输出结果 当作业执行成功后,可以在作业中心页面,单击作业名称,查看输出结果。 在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息,可以在操作列查看3D、合成路径等信息。
图1 作业中心 父主题: 作业管理
快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”,输入ECS初始账号,登录ECS。
图1 删除单个作业 批量删除作业 一次选中多个作业,单击“作业中心”页面上方的“删除”。 图2 批量删除作业 父主题: 作业管理
请求示例 创建分子对接作业,作业名称为demo-job, 受体文件为project:/dir/file,口袋中心位置的值为[0,0,0],口袋尺寸大小为[10,10,10],去除受体的水分子。
通过“作业中心”页面创建 新建作业 单击“新建”,在新建作业页面选择对应的模块。 图1 新建作业 单击“确定”,在对应的模块页面配置详细信息,具体请参考功能模块。 克隆作业 克隆已有的作业,作业的参数及流程一并克隆到新作业中。 在“作业中心”页面,单击作业操作列的“克隆”。
以下操作步骤是在“数据中心”页面下载数据至本地。 在“数据中心”页面,下载数据至本地。 选择待下载的数据,单击“操作”列“下载”即可。 或者单击“操作”列“下载为”,然后单击鼠标右键,选择“链接另存为”,下载数据。
快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”,输入ECS初始账号,登录ECS。
枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
最小长度:0 最大长度:10000000 表6 BoundBoxDto 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of doubles 口袋中心坐标,x、y、z轴的坐标。
可以通过单击右上角的“保存”,将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题: 通用工具
可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果。 单击按钮,可以收藏分子搜索结果,收藏后的结果可直接在收藏夹页查看。
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枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
数组长度:1 - 10 表7 DrugBoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标;x, y, z轴的坐标。
RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为项目路径,为公共数据场景时为obs地址。
表1 上传数据方式 上传数据方式 说明 “数据中心”页面上传 通过“数据中心”页面上传数据,支持上传最大为1GB,最多20个文件。 数据上传方法请参见“数据”页面上传。 父主题: 数据管理
最小值:0 最大值:20 响应参数 无 请求示例 设置口袋中心位置、大小和padding的值生成可渲染的口袋文件内容。
单击数据中心右上角“URL导入”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用URL导入 父主题: 数据管理