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参数类型 描述 mobile 否 String 用户手机号,纯数字,长度小于等于32位,当且仅当重置手机号时传入空串。必须与国家码同时存在。 最小长度:0 最大长度:32 areacode 否 String 国家码,当且仅当重置手机号时传入空串。中国大陆为“0086” 最小长度:0
ecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。在创建应用前,请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality
API请求的组成,并以调用IAM服务的获取用户Token接口来说明如何调用API,该API获取用户的Token,Token可以用于调用其他API时鉴权。 您还可以通过这个视频教程了解如何构造请求调用API:https://bbs.huaweicloud.com/videos/102987 。 请求URI 请求URI由如下部分组成。
上方的工具栏显示设计器的快捷控制操作。 由设置、新建作业、保存、另存为、删除、自动保存构成。 资源栏 左侧的资源栏显示项目中可以使用的应用和流程。 画布 中间区域为搭建流程的操作界面。 可以将应用拖拽至画布中,并进行编排创建。 可以将流程放置到画布中进行编排修改。 可通过“概览”展示流程的结构图。 可通过
初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。 同时集成了基于开源的Jupyter Notebook,
应用是生物信息学软件的镜像封装。例如,您可将Cell Ranger软件封装为镜像,并上传至EIHealth平台。通过应用把镜像引入,利用应用搭建分析流程,执行分析作业。 用于创建Notebook Notebook是一个交互式应用程序,用于代码的编写、调试、运行。创建Notebook
步骤4:创建并使用Notebook 步骤1:安装容器引擎 在制作自定义镜像时,您需要准备一台安装有Docker的机器。请使用自己的电脑搭建Docker环境,或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get
支持消息、邮件、安全、商标设置。 支持通过命令行工具对平台进行管理和使用,支持Windows、Linux系统。 开放API 优化 优化流程的搭建和运行过程。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2020年11月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 平台界面风格更新,新
本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果(https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821),并搭建虚拟药物筛选数据库。 图1 药物筛选之旅 父主题: 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选
“密码”。 “角色”分为管理员和操作员。权限区别请参见表 用户权限。 图2 必填信息 选填信息。选填信息包括“邮箱”、“国际电话区号”、“手机号码”、“用户资源配额”。 图3 选填信息 单击“确认”,完成子用户创建。 父主题: 用户管理
用户名中选择“用户管理”,在“操作”列中选择“安全设置”,重置其他用户的邮箱、手机和密码信息。 单击“重置邮箱”后,可以选择清除邮箱或绑定新邮箱。 单击“重置手机号”后,可以选择清除手机号或绑定新手机号。 单击“重置密码”后,输入新密码和确认密码。用户密码重置成功后,首次登录成功需要再次修改密码。
th所在目录。 cd /home/user-name/test/client/ 图3 客户端 使用Linux版本命令行工具时,您需要在本地搭建Linux环境,并将下载的health文件放至所需的目录下。macOS执行命令和linux一致, 如果当前目录为health所在目录,可以使用
获取路径。 cd /d d:\demo 图2 cmd窗口输入health命令 图3 获取路径 使用Linux版本命令行工具时,您需要在本地搭建Linux环境,并将下载的health文件放至所需的目录下。macOS执行命令和linux一致, 如果当前目录为health所在目录,可以使用
最大长度:32 mobile 否 String 用户手机号,纯数字,长度小于等于32位,当且仅当重置手机号时传入空串。必须与国家码同时存在。 最小长度:0 最大长度:32 areacode 否 String 国家码,当且仅当重置手机号时传入空串。中国大陆为“0086” 最小长度:0
移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号以及系统管理员权限的更改。在用户操作列,单击“编辑”,重置用户的相关信息。 最终租户可以编辑子用户角色、手机号、邮箱。 系统管理员只能编辑角色,非系统管理员无编辑权限。 图3 重置用户信息 重置密码
由一个应用组成。 您可以使用该工具创建流程,并进行修改、删除、查询、导入操作。对于由多个应用构成的流程,可通过设置不同应用的输入、输出关系搭建为流程。 作业管理 您可以使用该工具启动分析作业,并进行查询、删除、重试、取消操作。 notebook 您可以使用该工具创建noteboo
xamples”文件夹中,包含使用“genomeagent_examples”进行分析的示例,可供参考,以下均以example.ipynb教程示例进行。 表2 genome-agent示例 示例名称 说明 example.ipynb jupyter形式的代码示例。 example_with_user_modify
用户权限介绍 表1 用户权限说明 用户类别 权限 最终租户 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、邮箱和手机号、重置密码、移除用户。 系统管理员 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、移除用户。 非系统管理员 无相关编辑权限。 父主题: 用户管理
单击“立即创建”,完成fastqc应用的创建。 创建完成后的应用,将显示在应用列表中,您可以使用该应用创建分析作业。 图5 查看应用 步骤4:搭建流程、运行作业 进入“工具 > 流程”页面,点击“新建流程”进行新建流程,填写好流程名称,流程版本等信息。 图6 新建流程 将fastqc
如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录,请使用cd命令切换路径。例如,切换至D盘: cd /d d: 使用Linux版本命令行工具时,您需要在本地搭建Linux环境,并将下载的health文件放至所需的目录下。 如果当前目录为health所在目录,可以使用./health命令使用命令行工具。