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Nextflow引擎生命周期管理 安装Nextflow 查询Nextflow配置详情 卸载Nextflow 清理Nextflow缓存 查询Nextflow版本列表 父主题: Nextflow接口
模板管理 从其他项目导入模板 上传模板 查询模板列表 创建模板 查询模板详情 删除模板 父主题: 数据库管理
t-database”和“ligandAnnotation-database”数据库查看数据库详情,在“模板”页签单击“shennongProject”和“ligandAnnotation”查看模板详情。 “神农项目”药物虚拟筛选数据库 数据库呈现了新冠病毒靶点蛋白和药物的结合能
受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容
计算资源扩缩容 创建扩容策略 查询扩容策略列表 获取扩容策略详情 修改扩容策略 删除扩容策略 获取策略关联计算资源列表 获取策略伸缩历史 获取策略事件 启动自动扩容策略 停用自动扩容策略 修改缩容策略 查询缩容策略 父主题: 系统管理
资产管理 获取资产列表 获取属性值列表 查询资产详情 查询资产版本详情 更新资产指定版本的信息 删除资产指定版本 操作资产发布状态 父主题: 资产市场
数据库管理 引用数据库实例 获取实例列表 创建数据库实例 查询实例详情 删除实例 查询数据 导入数据 插入单条数据 删除数据 更新数据 父主题: 数据库管理
您可以使用该工具创建流程,并进行修改、删除、查询、导入操作。对于由多个应用构成的流程,可通过设置不同应用的输入、输出关系搭建为流程。 作业管理 您可以使用该工具启动分析作业,并进行查询、删除、重试、取消操作。 notebook 您可以使用该工具创建notebook,并进行查询、编辑、删除和启停等操作。
数据管理 创建文件夹 查询数据列表 获取桶存量信息 复制项目数据 导入项目数据 导入网上数据 引用项目数据 订阅资产市场数据 上传数据文件 批量删除项目数据 获取桶列表 查询项目级数据权限控制策略 设置项目级权限控制策略 获取数据详情 设置数据对象策略 发布数据资产 父主题: 数据管理
searchable: true # 列是否可查询,必填 tips: uuid # 列的查询提示,非必填, 若该列为可查询列,可提供查询提示 - name: user_name description:
创建者名称 最小长度:1 最大长度:128 from_time 否 Long 查询该时间之后创建的数据作业 最小值:1000000000000 最大值:9999999999999 limit 否 Integer 查询条数 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 name 否 String
ockerhub官网进行查询。 查看镜像是否pull成功。 用docker images命令查看镜像是否pull成功。如果您本地已经有很多镜像,防止查询出全部镜像,可在docker images命令后面添加 | grep pegi3s使查询更精准。 查询fastqc软件命令。非常熟悉fastqc软件则可跳过此步骤。
DATABASE_IMPORT --end-time -e 否 查询该时间之前创建的数据作业,获取数据作业列表时生效。 时间类型为时间戳。 --status -s 否 数据作业状态,根据作业状态筛选作业,获取数据作业列表时生效。 --begin-time -b 否 查询该时间之后创建的数据作业,获取数据作业列表时生效。
在“项目列表”中,展示了当前用户有权限访问的项目。 图1 项目列表 查看项目信息 项目信息中提供了项目设置,成员管理,数据审计,您可以通过如下方式查看。 在平台左上角选择项目名称,单击,进入项目设置页面。 图2 查看项目信息 项目设置 在项目设置页面,可以查看项目名称,该项目的数据存储OBS桶名称。所有
参数 是否必选 参数类型 描述 limit 否 Integer 限制量,单次查询总量[1, 1000],默认100 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 offset 否 Integer 偏移量,查询起始偏移,默认为0 最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 path
Nexflow流程管理命令 创建流程 修改流程 查询流程详情 删除流程
分子生成(MG) 新建分子生成任务接口 查询分子生成任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
√ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 开发环境 创建、导入 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 启、停 √ √ √ - - 数据库 创建、导入、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 药物虚拟筛选 创建、修改、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √
CPI作业管理 创建CPI作业 查询CPI作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
分子优化(MO) 新建分子优化任务接口 查询分子优化任务 父主题: API(AI辅助药物设计)