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配体力场:支持gaff/gaff2,蛋白力场gromacs力场与配体力场gaff/gaff2不兼容,如果蛋白力场选择了gromacs力场,则不支持上传配体。 图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”,配置靶点优化配置参数。 MD引擎:仅支持GROMACS。 时间步长:MD模拟的时间步长
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
--recursive -r 否 按指定的对象名前缀批量删除,批量删除时必选。 --jobs -j 否 批量删除对象时,批量任务的最大并发数,默认为5。取值范围[1,10]。 --fr -R 否 删除单个对象时生成结果清单文件。 --versionId -V 否 待删除对象的版本号。 --o -o
PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,仅支持FASTA,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1
p 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 archive-name 无 是 归档名称。 --path -p 是 归档的数据路径,多个对象用分号(;)分隔,开头不需要加/。例如, "xxx";"yyy"。 --description -d 否 归档描述。 --delete -l
数据库文件来源。 枚举值: public private url 是 String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id 否 String 数据库文件所在项目id,仅文件为数据中心时填写。
PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。
String 数据库文件来源。 枚举值: public private url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id String 数据库文件所在项目id,仅文件为数据中心时填写。
模型数据文件来源。 枚举值: public private url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id String 模型文件所在项目id,仅文件为数据中心时填写。