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LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich-332/lib 执行下列命令,导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。
0rc6/bin export LD_LIBRARY_PATH=/usr/mpi/gcc/openmpi-3.0.0rc6/lib64 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 # source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2
8.0.128/lib64 执行下列命令,导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel
/2018.0.128/lib64 执行下列命令,导入环境变量。 # source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 # which mpirun 图2 环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi-310/lib 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi-310/lib 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3
前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Spectrum MPI。 获取IBM Spectrum MPI软件包,需要进行注册。 获取的IBM Spectrum MPI软件包有两个,包括license和软件两部分: ibm_smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Aug11
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi-311/lib 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 # source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2
export MANPATH=$MPI_ROOT/share/man:$MANPATH unset MPI_REMSH 执行以下命令,查看环境变量导入是否成功。 # which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
如果存在多个pkey,使用英文逗号隔开。 执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 Platform MPI环境变量导入成功 执行下列命令,在单个ECS上运行Platform MPI。 执行以下命令,重新编译hello.c文件。 # mpicc hello.c
STAR-CCM+启动相关问题 STAR-CCM+使用OpenMPI启动时,命令中有"-x"和"--mca"导致启动失败 问题现象: STAR-CCM+使用OpenMPI启动时候命令中同时有"-x"和"--mca"会启动失败,OpenMPI不支持"-x"参数和"--mca"同时使用,报错如下图所示。