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在EIHealth平台,创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出,对于由多个应用搭建出来的流程,命令行工具中通过指定不同应用间的输入输出关系,完成应用的连接。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建流程,创建好的流程将同步显示到EIHealth平台。 获取流程模板
以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面,展开数据文件夹,选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。 单击鼠标右键,选择“链接另存为”,下载数据。 图1 下载数据 使用命令行工具下载数据 使用download命令将E
不完整。可通过手动删除文件中REMARK行来解决该问题。 如下所示: 分子优化靶点设置界面,受体展示正常。 但是下载该靶点文件后,使用通用工具Mol 3D Viewer打开,会出现蛋白显示不完整的情况,如下图所示。 此时可将受体文件中的REMARK行进行删除,即可解决该问题。 父主题:
--help可以替换成任何fastqc的命令,与linux类似。 步骤2:上传镜像至EIHealth平台 配置命令行工具。 若已完成配置,可跳过此步骤。 在命令行工具所在的目录,使用switch命令进入EIHelath平台的项目中。 # 命令结构 health switch project
苗设计与药物研发等工作中发挥着不可替代的基础性的作用;也将支撑病毒溯源、变异进化、致病机理等研究工作。华为云联合多家科研单位,推出基因组自动化鉴定云平台。该平台直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据,具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能,实现了对样本中可能存在的包
分享:关闭分享后,项目内数据不允许分享给其他项目,包括拷贝、引用两种方式。 下载:关闭下载后,项目内数据不允许下载至本地。 删除:关闭删除后,项目内数据不允许通过平台、命令行工具删除。 图1 数据保护策略 数据审计 平台通过云审计服务(CTS)提供操作记录的收集、存储和查询,审计操作可以设置导出用户的写操作(默认)
语言:选择中文或英文。 删除邮箱后,将不再发送邮件通知。 图1 邮件配置 邮箱配置完成后,单击“测试”,验证配置是否有误。配置成功后将在邮箱中收到测试通知。 图2 邮箱测试通知 收到邮箱测试通知后,单击“更新”,完成邮箱设置。 设置邮箱接收消息范围 在平台右上角用户名中选择“个人设置
使用EIHealth平台预置的流程进行运行作业。 步骤1:订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程,以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2:订阅数据 若您本地有需要分析的二代基因组数据,则您可以用本地的数据。数据上传方法请参见上传数据。
具有高性能、模块化等特性,是一个完全自主研发的分子模拟软件库。基于高毅勤教授课题组和华为团队的技术支持,已经实现自由能微扰加速10倍以上。测试 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
件会保存在该目录,请确保运行obsutil的用户对该路径有写权限。该路径的可用空间需要大于待下载对象的大小。 --dryRun -y 否 测试模式运行,不执行实际的下载操作。 --vlength -v 否 下载完成后,验证本地文件大小是否与桶中对象的大小一致。 --vmd5 -M
节约研发成本。 产品优势 提供开放的、易于扩展的平台架构。 提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产,提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程,并结合华为特有的高性能云计算,多样性算力,大数据等技术加速计算过程。
增量复制,设置该参数后,复制时会判断是否有同名文件,若有同名文件,则跳过不进行复制。 --fr -R 否 复制对象时生成结果清单文件。 --dryRun -y 否 测试模式运行,不执行实际的复制操作。 --crr -c 否 复制时使用客户端跨区域复制模式,以通过数据流的方式从源桶直接复制数据到目标桶,且两个桶可以是任意两个OBS服务的桶。
上传对象时生成结果清单文件。 --arcDir -g 否 上传文件成功后的归档路径,上传成功后的文件会移动到该本地路径下。 --dryRun -y 否 测试模式运行,不执行实际的上传操作。 --link -K 否 上传软链接文件/文件夹指向的真实路径。 如果未指定该参数,而待上传的文件是一个软
数据上传方法请参见“数据”页面上传。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealth平台,提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用,支持上传最大为48.8TB的单个文件。 数据上传方法请参见命令行工具概述。 对于非挂载目录以外的目录下的文件,重
是-2^1024 ~ +2^1024,也即-1.79E+308 ~ +1.79E+308。超出精度返回会保留小数点后16位的精度。 图1 测试数据 图2 创建数据库 导入数据 数据库创建好以后,您可以参照数据库模板格式,将已有的数据进行导入。 单击数据库右上角“导入数据”。 图3
数据上传方法请参见“数据”页面上传。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealth平台,提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用,支持上传最大为48.8TB的单个文件。 数据上传方法请参见命令行工具概述。 父主题: 数据管理
CSS集群管理 绑定CSS集群 获取CSS集群列表 获取最终租户CSS集群列表 测试CSS集群连接 CSS集群解绑 父主题: API(盘古辅助制药平台)
从其他项目导入的镜像,在镜像列表“源项目”列中,显示所属的项目。 客户端上传镜像 使用命令行工具eihealth-toolkit上传镜像,详细的上传过程请参见上传镜像到SWR镜像仓库,详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 父主题: 镜像管理
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题: 系统管理
步。 表1 上传数据方法 上传方法 说明 “数据”页面上传 通过“数据”页面上传数据,支持上传最大为1GB的单个文件。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealth平台,提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用,支持上传最大为48.8TB的单个文件。