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据到数据库时此参数必填。 --current-project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 引用单个数据库实例 health
重命名目标流程名称，不填时与源流程名称保持一致。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 从源项目lmx-project导入流程，并重命名流程。
--workflow-name -t 否 流程名。 --user-name -u 否 用户名。 --job-name -j 否 任务名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 使用health get job
--project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索应用。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 使用health get app
否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索workflow 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 使用health get workflow
镜像管理简介 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台
创建应用。 本示例中制作FastQC镜像，并基于镜像创建应用，运行分析作业。 镜像简介 由于生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。 将生物信息学软件封装
切换路径 使用cd命令在EIHealth项目中切换数据路径。 命令结构 health cd <path> 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 当前目录，不进行跳转。 health cd
步骤4：查看与执行操作命令 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。配置信息导入后，即可查询命令行工具支持的操作，并执行相关命令，使用EIHealth平台。 详细的操作命令请参见其他章节。 查询操作命令列表。
同时使用project-name和--current，查询当前所在的项目详情信息。 --policy -p 否 查看项目的数据权限策略。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 不指定参数。 执行health
文件内容格式：{"ids":"id1;id2;id3"}。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 使用job-id导出作业 health
否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 删除某个文件的分段任务 health
列举桶内分段上传任务的起始位置，必须与--marker配合使用。返回结果是对象名和UploadId按照字典序排序后该参数之后的所有分段上传任务。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 假设“lmx-test-01
包的校验文件。例如：Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64 ，它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。 安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。
上传数据 NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。
包的校验文件。例如：Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64 ，它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。 安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。
”字符本身。如果待移动的对象名匹配该参数，则跳过该对象的移动。 建议使用引号传递该匹配模式（macOS/Linux操作系统使用单引号，Windows操作系统使用双引号）防止特殊符号被操作系统转义，导致不可预期的结果。该匹配模式作用于对象全路径（含从根路径开始的对象前缀和对象名，例如
关键概念 镜像 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平
”字符本身。如果待复制的对象名匹配该参数，则跳过该对象的复制。 建议使用引号传递该匹配模式（ macOS/Linux操作系统使用单引号，Windows操作系统使用双引号）防止特殊符号被操作系统转义，导致不可预期的结果。 该匹配模式作用于对象全路径（含从根路径开始的对象前缀和对象名，例
表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 否 项目名称，不填时默认为当前所在项目。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 执行以下命令，删除项目demo-project。
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