检测到您已登录华为云国际站账号,为了您更好的体验,建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
镜像管理简介 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台
包的校验文件。例如:Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64 ,它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。 安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例,介绍安装命令行工具的方法。
包的校验文件。例如:Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64 ,它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。 安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例,介绍安装命令行工具的方法。
Failed 未满足前提条件,服务器未满足请求者在请求中设置的其中一个前提条件。 413 Request Entity Too Large 由于请求的实体过大,服务器无法处理,因此拒绝请求。为防止客户端的连续请求,服务器可能会关闭连接。如果只是服务器暂时无法处理,则会包含一个Retry-After的响应信息。
针对不同操作系统,eihealth-toolkit下载地址如下所示。 表1 下载列表 支持平台 下载地址 Windows 64位 health-windows-x86_64.zip、health-windows-x86_64.zip.sha256 Linux ARM 64位 health-linux-aarch64
快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”,输入ECS初始账号,登录ECS。 图1 云服务器列表 安装容器引擎。 例如,
快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”,输入ECS初始账号,登录ECS。 图1 云服务器列表 安装容器引擎。 启动一个空白的基础容器,并进入容器。
针对不同操作系统,eihealth-toolkit下载地址如下所示。 表1 下载列表 支持平台 下载地址 Windows 64位 health-windows-x86_64.zip、health-windows-x86_64.zip.sha256 Linux ARM 64位 health-linux-aarch64
HTTP请求方法 方法 说明 GET 请求服务器返回指定资源. PUT 请求服务器更新指定资源。 POST 请求服务器新增资源或执行特殊操作。 DELETE 请求服务器删除指定资源,如删除对象等。 HEAD 请求服务器资源头部。 PATCH 请求服务器更新资源的部分内容。当资源不存在的时
TaskInstanceMetadataRsp object 实例元数据信息 spec TaskInstanceSpecRsp object 实例cpu和内存使用率信息 表6 TaskInstanceStatusRsp 参数 参数类型 描述 phase String 实例执行状态 pod_ip String
${dir-out}/adme_info.txt > ${dir-out}/adme.log 2>&1";cat ${dir-out}/adme.log # windows系统下镜像启动命令 "bash -c """source activate my-rdkit-env ^&^& python adme
lmx-project-01/demo-image --type APP --description 'this is a demo' Windows health docker update lmx-project-01/demo-image --type APP --description
用户管理 用户管理介绍 创建子用户 导入用户 登录平台方式 管理用户 父主题: 用户指南(基因平台)
--chip -c 否 芯片类型,只支持X86和ARM。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Windows health docker push demo-image:v1.0 -d "this is a desc" -t APP Linux
Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。
project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 id 是 String 云服务器ID 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是
环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,ECS如果为Linux操作系统,可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 quantity Integer 剩余服务器数 cpu Integer 剩余CPU ram Integer 剩余内存 请求示例 获取节点剩余配额 https://eihealth.cn-north-4
--link -K 否 上传软链接文件/文件夹指向的真实路径。 如果未指定该参数,而待上传的文件是一个软链接且该软链接指向的目标文件不存在,则Windows操作系统会产生“The system cannot find the file specified”的上传失败异常,macOS/Linux操作系统会产生“No
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 server String 服务器地址 subject_prefix String 展示名 user_name String 用户名 email String 邮箱 language