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安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装，安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
--yaml -y 否 获取任务实例详情时，以yaml格式输出任务实例详情（默认json格式）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
选择模型数据。可选择数据中心数据，或者示例数据。 仅支持CSV格式，数据条数支持100-50000条，文件不大于5MB。 组织共享 如果关闭，则该模型只能自己使用。 如果开启组织共享，则其他子用户也可以使用您的模型做分析。 默认为关闭。 单击“确定”。 每人最多可以创建100个模型，每次使用模型时，最多可以使用10个。
节点存储：建议选择“超高I/O”。 单击下一步“网络配置”。 图3 节点 网络配置：输入管理员密码，公网访问选择“自动绑定”，单击“下一步高级配置”。 图4 网络配置 单击“下一步：高级配置”，在弹窗里单击“确认”。 图5 确认 高级配置。 图6 高级配置 确认配置，无误后单击“立即创建”，即可完成购买。
发布应用的名称。名称长度为1-56，以字母开头，只允许出现中划线(-)、下划线(_)、字母和数字，且必须以字母或数字结尾。 展示名称 发布成功后在组织共享中展示的名称。若不填写，展示的名称和应用名称相同。发布成功的应用不支持修改展示名称。 版本 发布应用的版本。 版本长度必须为1-24个字符
发布镜像的名称。名称长度为1-128个字符，以小写字母或数字开头，只允许出现中划线(-)、下划线(_)、小写字母和数字，且必须以小写字母或数字结尾。 展示名称 发布成功后在组织共享中展示的名称。若不填写，展示的名称和镜像名称相同。发布成功的镜像不支持修改展示名称。 版本 发布镜像的版本。 版本长度必须为1-64个字符
您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 镜像 Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境，里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。
发布数据参数说明 参数 说明 名称 发布数据的名称。名称长度必须为1-128个字符，只支持字母，数字，中划线和下划线。 展示名称 发布成功后在组织共享中展示的名称。若不填写，展示的名称跟发布数据的名称保持一致。发布成功的数据不支持修改展示名称。 版本 发布数据的版本。 版本长度必须为1-
合成路径规划 合成路径规划基于盘古药物分子大模型，根据给定的目标分子，可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。
在“功能模块”页面，选择对应的模块，单击“立即使用”。 在具体的功能模块页面，配置相关参数信息。具体参考功能模块章节。 通过“作业中心”页面创建 新建作业 单击“新建”，在新建作业页面选择对应的模块。 图1 新建作业 单击“确定”，在对应的模块页面配置详细信息，具体请参考功能模块。 克隆作业 克隆已有的作
情况，直至购买了计算资源或者任务超时才会停止。 单击平台右上角的账号名称，会出现账号的相关操作，包括系统资源，系统配置等。注意这里只有管理员账号有系统资源，系统配置等操作，具体说明请参见用户管理。 图1 系统资源 父主题： 购买计算资源（主账号操作）
图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”，配置靶点优化配置参数。 MD引擎：仅支持GROMACS。 时间步长：MD模拟的时间步长，范围支持0<时间步长≤5fs，默认是2fs。 温度：MD模拟的温度，范围支持0<温度≤1000K，默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy
从头生成：通过指定的口袋从头生成小分子。 选定设计方式后，上传靶点结构，并配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构：选择靶点结构文件，仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体，则默认只处理第一个。 单击下一步，配置配体文件，支持选择原始配体与上传配体文件两种方式 选择原始配体：选择靶
或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序，可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片，进入分子搜索页面。 在配置页面，进行分子搜索配置，包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面 输入小分子：可以通过输入SMILES、上传文件或者直接绘制输入小分子。最终以SMILES为准。
流程创建成功后，您可以对流程进行编辑，删除操作。 编辑 选择已创建成功的流程，单击操作列的“编辑”，进入流程编辑页面。除了流程名称不能更改，您可以修改已有流程的其他参数配置项。 删除 通过单击操作列“删除”，可删除对应的流程。 下载流程文件 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程文件后的“下载”，可下载该流程文件。
构相似的化合物聚成一类，从而找到有效骨架 ，辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件；文件大小不超过5G；小分子支持10-10
小分子会自动去重。 数据文件列名：选择数据库列名，仅解析前100个列名，支持选择12个列名保存到数据库。 组织共享： 如果关闭，则该数据库只能自己使用。 如果开启组织共享，则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间
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创建项目 新用户进入平台后需要自己创建项目，单击“创建项目”按钮，填写项目名称以及选择对应的数据保护策略，数据保护策略参考下面配置。 图1 创建项目 单击项目名称可进入到对应的项目中。 图2 进入项目
add_nodes_for_mem_rule 否 Integer 满足扩容策略中mem分配率时增加的节点数 最小值：1 最大值：50 响应参数 无 请求示例 更新扩容策略配置，更改名称为strategy_4vCPUS_8GB https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.c
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