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跳过的header行数。不指定参数值时默认为0。 --delimiter -e 否 常用的三种分隔符为(;,\t),也可以根据导入数据的文件格式设定其他分隔符。 --files -f 否 生成实例数据的文件列表,多个文件用分号(;)分隔。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
bash -c "source activate my-rdkit-env && python adme.py --file_in ${file-in} --file_out ${dir-out}/adme_info.txt > ${dir-out}/adme.log 2>&1";cat
选择一个文件上传。 图7 上传文件 编辑文件 JupyterLab可以在同一个窗口同时打开几个Notebook或文件(如HTML、TXT、Markdown等),以页签形式展示。 JupyterLab的一大优点是,可以任意排版多个文件。在右侧文件展示区,您可以拖动打开文件,随意调整文件展示位置,可以同时打开多个文件。
最小长度:3 最大长度:32 relative_path 是 String 生成数据库实例的文件相对路径 最小长度:0 最大长度:1024 output_file_type 是 String 生成数据库实例的文件类型。枚举值:csv、txt、vcf 枚举值: txt vcf csv 响应参数
靶点优化基于分子动力学模拟和结构聚类,实现靶点结构优化 单击“靶点优化”功能卡片,进入配置页面。 配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件,文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体,默认只处理第一个。 靶点预处理: 去配体:提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电
name: lk-app-0121 version: 1.0.0 summary: dsfsdf description: fdsfsdf labels: - fdsfsdfsdf image: ei_eihealth_x00356764_02/modela
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 数据(文件夹、文件)总数量 objects Array of BucketObjectDto objects 数据列表 表5 BucketObjectDto
删除标签 功能介绍 删除标签 URI DELETE /v1/{project_id}/system/labels/{label_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
作业投递后运行失败,日志显示File name too long。 图12 运行出错的应用日志 排查思路 检查输入文件的路径单级名称长度是否超过255个字符。若单级名称长度未超过255个字符请联系技术支持。 解决方案 单级目录名称长度超过255个字符。 不使用SFS或者EVS加速。 若必
加速效率:IO加速>本地盘加速>无 无:作业运行于OBS中,不使用加速。 IO加速:IO加速使用弹性文件服务(SFS)提供高性能的数据读写,作业运行时,会将非最终结果的数据存储在SFS中用以提高任务运行效率,作业执行完成后会清理释放SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速,开启前需要先购买性能加速。
修改权限 修改目录、文件权限。 命令结构 health chattri [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --path -p 附加参数,可选。 修改权限的目录或文件绝对路径。 --delete-policy -d 附加参数,可选。 设置目录或文件是否允许删除。取值包括:allow、deny。
偏移量,查询起始偏移,必须由数字组成,默认为0,取值范围[0,100000000] 最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 path 否 String 指定文件夹(项目名称:/路径) 最小长度:0 最大长度:2000 search_key 否 String 查询关键词 最小长度:0 最大长度:2000
创建数据库 创建数据库 数据库支持使用.csv、.txt、.vcf文件生成数据库。创建的数据库需要保证数据文件与模板对应。创建数据库时,可以不选择导入的数据文件,建立空的数据库,后期可以新增数据行或者导入数据。如果使用自动作业的数据表创建数据库,在导入数据,需要参照数据库模板格式进行导入。
ken。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 report_files Array of NextflowJobReportFile objects 作业报告文件列表 表4 NextflowJobReportFile
获取节点标签集 功能介绍 获取节点标签集 URI GET /v1/{project_id}/system/cluster/labels 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
study作业结果的数据库实例id relative_path String 生成study作业结果的文件的相对路径 output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String 使用的workflow名称 label String
算资源标签管理。 图4 CPU、内存、GPU 填写输入参数、输出参数。 参数填写时,输入参数及输出参数有字符串(String),文件(File),文件夹(Directory),枚举(Enum)四种类型。 图5 参数信息 对于输入参数,打开“并发”开关,在启动作业时,每个参数可以设
-l 否 是否删除已归档数据(默认false)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --storage-type -s 否 归档的存储类型,支持STANDARD和COLD。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程。
修改跨域归档设置 功能介绍 修改跨域归档设置 URI PUT /v1/{project_id}/system/archive-configs/{region_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values 否 Array of strings 参数取值 如