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在HPC集群上运行Spectrum MPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行Spectrum MPI应用(IBM Spectrum MPI v10.1)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
据Mellanox提供的操作指导进行安装。 以操作系统CentOS 7.3为例,推荐安装4.2.1版本的安装包,下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0.0-rhel7.3-x86_64.tgz”,并执行以下命令进行安装: # yum install tk tcl
03r-ce.bin 安装Platform MPI。 # ./platform_mpi-09.01.04.03r-ce.bin 根据系统提示安装Platform MPI,默认安装到“/opt/ibm/platform_mpi”文件夹下。 图1 Platform MPI成功安装 配置环境变量。
名中超过两个连续字符的部分。 Test12$@ (可选)高级配置。 如需使用“高级配置”中的功能,请单击“现在配置”。否则,请单击“暂不配置”。 用户数据注入:主要用于创建裸金属服务器时向裸金属服务器注入用户数据。配置用户数据注入后,裸金属服务器首次启动时会自行注入数据信息。 设置“裸金属服务器名称”。
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节操作指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本4.0.2a1为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
处理方法 检查“/etc/ssh/sshd_config”配置文件,确保配置文件中“AuthorizedKeysFile”添加了“/usr/local/.hpccluster/role/.ssh/authorized_keys”配置项。 检查“/usr/local/.hpccluster/role/
interface)方式。 前提条件 已确保Linux云服务器网卡设置为DHCP的方式动态获取网络地址。 已清理Linux云服务器中的udev配置规则。 已安装并配置Cloud-init工具。 已卸载Linux云服务器中挂载的所有数据盘。 控制台方式 登录管理控制台。 选择“计算 > 弹性云服务器”。
ense.sh 执行以下命令,安装软件部分。 # rpm -ivh ibm_smpi-10.1.0.3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm 图2 安装软件 配置MPI环境变量。 默认情况下,Spectrum MPI会安装至“/opt/ibm/spect
在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行IB驱动自带的MPI应用(3.0.0rc6版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使
UEFI图2,否则系统无法启动。 图1 创建系统盘镜像 图2 选择启动方式 为创建的私有镜像打标签 登录到 API Explorer:https://apiexplorer.developer.huaweicloud.com/apiexplorer/doc?product=IMS&api=Up
$ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F # service firewalld stop 执行以下命令,给参与测试的弹性云服务器配置主机名。 # hostnamectl set-hostname vm1 执行
按照提示输入Enter或1(accept the agreement)直到安装完成,以下为安装成功界面。 图1 Platform MPI安装成功 默认安装路径为/opt/ibm/platform_mpi。 配置MPI环境变量。 执行以下命令,获取pkey。 # cat /sys/c
的高性能计算,同时集成基础服务、业务软件等,实现一键式开通部署等功能,支持常用作业调度软件,例如slurm、sge及华为多瑙(Huawei commercial HPC Donau Scheduler)调度器的自动化部署,使用HPC-S²控制台可以方便的对集群、节点以及共享存储进行查看以及管理操作。
本节操作介绍创建HPC集群的方式,以及创建流程,引导您一站式完成集群的创建、配置,并在HPC-S²上完成高性能计算作业。 部署方式简介 购买高性能计算解决方案:根据实际计算需求购买HPC集群,可以在购买时同时指定管理节点配置与计算节点配置。 图1 购买HPC集群 使用已有节点部署HPC集群:在已有节点资源的前提下,指
HPC-S²应用场景 计算资源创建:HPC-S²支持一键式报价和一键式购买HPC集群,并在创建集群时自动部署所配置的调度器、域控制器以及运行时的依赖。 计算资源配置:HPC-S²支持计算资源的多种配置管理,包括集群管理、节点管理、扩容集群节点及资源状态查看等。 HPC-S²使用限制 HPC解
--with-mxm=/opt/hpcx-v2.0.0/mxm # make all install 图1 安装OpenMPI 系统回显的安装过程如图1所示,且退出后无报错,说明安装OpenMPI成功。 配置MPI环境变量。 在“~/.bashrc”添加如下环境变量: export PATH=$P
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
如果选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export IBM_SPECTRUM_MPI_LICENSE_ACCEPT=no 安装License部分。 选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议的,执行以下命令: # rpm -ivh
查看已有节点部署集群的进度 操作场景 使用已有节点部署集群的命令下发之后,如需查看集群的部署进度,可进入一站式HPC服务提供的“进度”页查看当前集群部署的具体进展和详细信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击操